More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7536 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7536  putative enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
268 aa  546  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0483  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  80.97 
 
 
268 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357471  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  84.79 
 
 
267 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.0360183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0272  enoyl-CoA hydratase/isomerase  83.21 
 
 
268 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.342358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0552  enoyl-CoA hydratase/isomerase  78.73 
 
 
267 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.86 
 
 
269 aa  278  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.504232  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  49.07 
 
 
260 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5361  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.82 
 
 
273 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00524739  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0442  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.79 
 
 
255 aa  211  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475404  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.59 
 
 
267 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4536  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.83 
 
 
250 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3862  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.57 
 
 
186 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1056  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 
255 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  0.516126 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.32 
 
 
663 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
259 aa  132  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  32.68 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3224  enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0829  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
257 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
260 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.65 
 
 
280 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  31.64 
 
 
258 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.27 
 
 
271 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.57 
 
 
651 aa  122  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.57 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.38 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.55 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65840  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.74 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4089  enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
251 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  28.96 
 
 
262 aa  120  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.89 
 
 
260 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.89 
 
 
260 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4359  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.81 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5713  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.37 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
271 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.01 
 
 
662 aa  118  9e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  30.88 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.97 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  31.94 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
263 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  31.87 
 
 
263 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 
255 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.19 
 
 
269 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3723  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.81 
 
 
267 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.736572  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4352  enoyl-CoA hydratase  28.09 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  32.08 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.33 
 
 
258 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.74 
 
 
267 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0603  enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 
258 aa  115  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4632  enoyl-CoA hydratase  28.46 
 
 
258 aa  115  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0403181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.46 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.92 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1306  short chain enoyl-CoA hydratase  29.89 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0288681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4651  enoyl-CoA hydratase  28.24 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4420  enoyl-CoA hydratase  28.24 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4259  enoyl-CoA hydratase  28.24 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4636  enoyl-CoA hydratase  28.24 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4761  enoyl-CoA hydratase  28.24 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.642301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4652  enoyl-CoA hydratase  28.24 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.41 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  29.73 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  29.73 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  29.34 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.78 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1985  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.46 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0672  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.6 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  29.73 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0918  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.02 
 
 
657 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  29.73 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.3 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4271  enoyl-CoA hydratase  27.86 
 
 
258 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  30.63 
 
 
263 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.48 
 
 
269 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  32.63 
 
 
267 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
258 aa  113  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  31.75 
 
 
258 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.83 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  32.58 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0790  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  30.97 
 
 
260 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
259 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  32.55 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.73 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.97 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.32 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0294  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.42 
 
 
261 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.0000157616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>