More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6494 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6494  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 482 aa  942    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  55.46 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 496 aa  306  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 520 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 477 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  34.79 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 501 aa  272  9e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 492 aa  269  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.89 
 
 		 481 aa  266  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 498 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.18 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  41.81 
 
 		 501 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.77 
 
 		 514 aa  262  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 502 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 497 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 492 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.2 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 511 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 505 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 502 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 502 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  39.91 
 
 		 481 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 502 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 502 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 496 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 		 503 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 498 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 502 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 502 aa  259  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.39 
 
 		 489 aa  259  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  38.51 
 
 		 502 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.11 
 
 		 491 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 517 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  36.95 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.55 
 
 		 503 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  34.67 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.05 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.46 
 
 		 509 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.69 
 
 		 485 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.92 
 
 		 501 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.91 
 
 		 503 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.55 
 
 		 523 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 470 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 492 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 490 aa  256  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.79 
 
 		 496 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000554  transcriptional regulator GntR family/aminotransferase class-i  33.62 
 
 		 481 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.21 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  39.05 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 496 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.65 
 
 		 473 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 476 aa  253  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 495 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 509 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 444 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.86 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 488 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.86 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 485 aa  252  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 476 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 488 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 488 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  35.89 
 
 		 496 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 488 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 488 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  35.24 
 
 		 520 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 488 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 501 aa  250  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 569 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05334  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 470 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.55 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 491 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.44 
 
 		 501 aa  248  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.82 
 
 		 495 aa  248  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 509 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.31 
 
 		 509 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 562 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 492 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.2 
 
 		 497 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.55 
 
 		 499 aa  246  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.22 
 
 		 471 aa  245  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  33.56 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.83 
 
 		 495 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  36.42 
 
 		 506 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.42 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  35.57 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>