51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6197 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6197  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2829  hypothetical protein  41.64 
 
 		 280 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.023481  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2639  hypothetical protein  40 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000954423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1499  hypothetical protein  42.23 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0914941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4129  hypothetical protein  59.62 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1884  hypothetical protein  38.14 
 
 		 119 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1710  hypothetical protein  32.14 
 
 		 134 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.661743  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2734  hypothetical protein  29.22 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0802358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4945  hypothetical protein  28.91 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0175  hypothetical protein  31.15 
 
 		 135 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4354  hypothetical protein  29.75 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3722  hypothetical protein  28.79 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  0.0261827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4974  hypothetical protein  29.23 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1887  hypothetical protein  31.45 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2264  hypothetical protein  32.23 
 
 		 213 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.144386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1333  hypothetical protein  27.5 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5701  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1674  hypothetical protein  31.03 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3624  hypothetical protein  30.17 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3305  hypothetical protein  29.75 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4359  hypothetical protein  36.73 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3433  hypothetical protein  28.47 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5160  hypothetical protein  28.26 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.131388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2677  hypothetical protein  30.33 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4794  hypothetical protein  45.83 
 
 		 150 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0246667  normal  0.215514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3698  hypothetical protein  29.73 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2391  hypothetical protein  30.33 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.69026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5609  hypothetical protein  31.48 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.343437  normal  0.446429 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0912  hypothetical protein  28.81 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3413  hypothetical protein  26.61 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3728  hypothetical protein  33.67 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.607549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2974  hypothetical protein  32.23 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2038  hypothetical protein  29.6 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1740  hypothetical protein  31.63 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2668  hypothetical protein  28.7 
 
 		 147 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5099  hypothetical protein  32.14 
 
 		 111 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0959389  normal  0.741523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4924  hypothetical protein  28.68 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2348  hypothetical protein  28.7 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1379  hypothetical protein  27.43 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.951506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2791  hypothetical protein  30.7 
 
 		 129 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.385318  normal  0.988228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1973  hypothetical protein  28.46 
 
 		 179 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3095  hypothetical protein  29.37 
 
 		 143 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0555  hypothetical protein  28.33 
 
 		 136 aa  49.3  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0594263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1747  hypothetical protein  28.21 
 
 		 128 aa  49.3  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838706  normal  0.0182475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2011  hypothetical protein  27.64 
 
 		 170 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2287  hypothetical protein  27.64 
 
 		 170 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56667 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0919  hypothetical protein  37.74 
 
 		 126 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  normal  0.0895293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2244  hypothetical protein  37.74 
 
 		 126 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6954  hypothetical protein  32.43 
 
 		 112 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3794  hypothetical protein  30.25 
 
 		 134 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1124  hypothetical protein  30.34 
 
 		 137 aa  42.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>