More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4638 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4638  putative two-component histidine kinase  100 
 
 		 243 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.032763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 654 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0044  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 560 aa  128  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 556 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 658 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 660 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 661 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 553 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1550  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 350 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0727  putative signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 476 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 694 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  32.06 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 351 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 351 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 351 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 351 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 351 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 421 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222367  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 355 aa  93.2  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 381 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 381 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 381 aa  92.8  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 485 aa  92  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  29.72 
 
 		 387 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3119  ATPase domain-containing protein  37.13 
 
 		 535 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 509 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 526 aa  89  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3092  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 425 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 424 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 421 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1982  sensor histidine kinase, putative  26.44 
 
 		 344 aa  87  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 344 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 345 aa  86.3  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 471 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 424 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.329696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  34.78 
 
 		 413 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  30.88 
 
 		 461 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 332 aa  85.5  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 475 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  35.19 
 
 		 349 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2634  histidine kinase  36.27 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000175326  hitchhiker  0.00557176 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  31.53 
 
 		 740 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  32.68 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  32.34 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  33.68 
 
 		 459 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  30.19 
 
 		 466 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2480  histidine kinase  33.66 
 
 		 350 aa  82  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.90361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 665 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  31.84 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0123  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  31.84 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 546 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  30.99 
 
 		 2361 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 682 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  31.34 
 
 		 575 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  32.57 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  31.19 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  32.09 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4528  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25442  normal  0.575982 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 748 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3044  methanol utilization control sensor protein MoxY, putative  31.43 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  27.49 
 
 		 592 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0877  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 474 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.858486  normal  0.37178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  30.43 
 
 		 384 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  32.39 
 
 		 363 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0011  histidine kinase  26.34 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  28.19 
 
 		 497 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 564 aa  78.6  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 478 aa  78.6  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  30.2 
 
 		 664 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  31.56 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 703 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  27.59 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  30.05 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  27.78 
 
 		 1739 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  29.81 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  29.61 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  28.57 
 
 		 619 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  28.18 
 
 		 680 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>