More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4322 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4322  putative Beta-hexosaminidase  100 
 
 
476 aa  952    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127427  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2290  glycoside hydrolase family 3 protein  43.76 
 
 
429 aa  306  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.93 
 
 
511 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.06 
 
 
426 aa  136  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.86 
 
 
365 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.86 
 
 
365 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  31.35 
 
 
589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.58 
 
 
511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.79 
 
 
337 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  33.33 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  33.66 
 
 
382 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  33.55 
 
 
365 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  26.45 
 
 
520 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.54 
 
 
398 aa  126  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.05 
 
 
354 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  35.05 
 
 
354 aa  126  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  36.78 
 
 
575 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.64 
 
 
373 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.54 
 
 
484 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  36.63 
 
 
575 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  30.68 
 
 
378 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.75 
 
 
528 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  31.69 
 
 
360 aa  124  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  31.03 
 
 
481 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  32.27 
 
 
503 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  31.69 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  34.15 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  34.15 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.58 
 
 
420 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  31.6 
 
 
520 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  34.15 
 
 
336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  34.15 
 
 
336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.5 
 
 
492 aa  120  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.34 
 
 
698 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.11 
 
 
387 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.46 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.09 
 
 
534 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  30.33 
 
 
633 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.09 
 
 
534 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  26.13 
 
 
557 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  31.48 
 
 
356 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  35 
 
 
656 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  29.51 
 
 
375 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.17 
 
 
586 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  33.8 
 
 
327 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.21 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  30.77 
 
 
585 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  27.19 
 
 
541 aa  116  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  31.48 
 
 
313 aa  116  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.56 
 
 
543 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.32 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.39 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0601  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.95 
 
 
381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0823164 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4457  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.14 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0149935  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  31.11 
 
 
313 aa  114  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1398  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.46 
 
 
362 aa  114  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.6 
 
 
490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  29.97 
 
 
370 aa  114  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  30.69 
 
 
427 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  32.36 
 
 
631 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.1 
 
 
552 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.63 
 
 
490 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1761  beta-hexosaminidase  30.25 
 
 
349 aa  113  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  30.03 
 
 
344 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  32.38 
 
 
332 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  26.6 
 
 
351 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  32.87 
 
 
388 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.85 
 
 
379 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1805  glycoside hydrolase family protein  35.46 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.174272  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.99 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1525  beta-hexosaminidase  33.68 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.276065  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  27.35 
 
 
350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  31.75 
 
 
538 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01720  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.38 
 
 
383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651137  normal  0.324393 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1468  beta-hexosaminidase  33.68 
 
 
335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0176842  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.25 
 
 
582 aa  111  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 
357 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3725  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.91 
 
 
308 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.646228  normal  0.35117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.57 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  32.03 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  33.33 
 
 
542 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  29.47 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.97 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.69 
 
 
845 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.92 
 
 
580 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3621  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.01 
 
 
367 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2510  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.09 
 
 
342 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.69 
 
 
591 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  31.35 
 
 
604 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1199  glycoside hydrolase family 3 protein  35.75 
 
 
483 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  27.59 
 
 
517 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  31.67 
 
 
336 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  31.88 
 
 
592 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  28.19 
 
 
528 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  31.36 
 
 
336 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1140  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.45 
 
 
335 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  31.34 
 
 
386 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.87 
 
 
594 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0219  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.42 
 
 
397 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>