95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4105 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  717    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6303  acyltransferase 3  33.04 
 
 
389 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  28.7 
 
 
358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  31.35 
 
 
366 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2427  acyltransferase 3  26.89 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0841199  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0243  acyltransferase family protein  33.23 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473952  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  27.17 
 
 
377 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  28.83 
 
 
389 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  30.77 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  27.6 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  24.79 
 
 
381 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  28.57 
 
 
382 aa  60.1  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  36.24 
 
 
369 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0719  acyltransferase-like protein  27.51 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.838666  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  26.77 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  25.52 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  27.56 
 
 
399 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4978  acyltransferase 3  30.27 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  27.92 
 
 
327 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  29.27 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  33.33 
 
 
359 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  32.89 
 
 
356 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0486  hypothetical protein  23.99 
 
 
390 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  26.8 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  28.85 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  27.52 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  30.41 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  33.99 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  29.1 
 
 
419 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  30.11 
 
 
378 aa  50.1  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  31.87 
 
 
359 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0728  acyltransferase 3  30.99 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416646  normal  0.548123 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  33.13 
 
 
760 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  29.07 
 
 
381 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  33.11 
 
 
621 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  25.85 
 
 
403 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  27.59 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  30.07 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  28.86 
 
 
349 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  29.17 
 
 
366 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  31.13 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.39 
 
 
374 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  32.19 
 
 
336 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  30.65 
 
 
625 aa  47  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  28.34 
 
 
362 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  25.93 
 
 
377 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  28.92 
 
 
395 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  28.92 
 
 
395 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0741  acyltransferase 3  30.57 
 
 
396 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387687  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2149  acyltransferase 3  27.53 
 
 
388 aa  46.2  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  32.03 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  34.68 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  29.01 
 
 
376 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  25.9 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  28.66 
 
 
376 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  26.23 
 
 
352 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  26.51 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  31.33 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  26.47 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  30.07 
 
 
423 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  30.5 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  26.85 
 
 
362 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  28.28 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  30.26 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  31.79 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  29.35 
 
 
652 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  27.83 
 
 
436 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.82 
 
 
353 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1075  acyltransferase 3  27.88 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.636973  normal  0.239028 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0560  acyltransferase 3  23.45 
 
 
370 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  34.62 
 
 
393 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  23.84 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  34.48 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  28.1 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  29.8 
 
 
335 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  32.03 
 
 
354 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  27.54 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  27.63 
 
 
336 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0841  O-acetyltransferase  28.83 
 
 
357 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  28.38 
 
 
383 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  30.19 
 
 
629 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  26.51 
 
 
360 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2850  acyltransferase 3  29.5 
 
 
379 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4484  acyltransferase 3  33.06 
 
 
360 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304176  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  28.4 
 
 
508 aa  43.1  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  29.19 
 
 
364 aa  43.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  32.12 
 
 
404 aa  43.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.39 
 
 
359 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  28.21 
 
 
360 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  27.59 
 
 
362 aa  42.7  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  30.13 
 
 
634 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  31.37 
 
 
665 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  28.67 
 
 
371 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  31.79 
 
 
344 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  25.44 
 
 
382 aa  42.7  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>