267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3705 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  100 
 
 		 353 aa  703    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  35.01 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  31.44 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  31.58 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  30.9 
 
 		 367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  29.53 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  32.95 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  33.51 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  29.78 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  29.01 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  31.14 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  30.55 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  34.62 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  32.87 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  30.92 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  32.16 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  28.61 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  33.15 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  31.41 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  30.29 
 
 		 377 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  28.12 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  31.72 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  30.66 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  27.6 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  32.2 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  32.29 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  29.14 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  28.25 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  29.44 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  30.36 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  29.16 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  29.65 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  28.97 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  32.68 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  28.37 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  28.36 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  26.88 
 
 		 342 aa  89.4  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  28.91 
 
 		 376 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  28.02 
 
 		 351 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.33 
 
 		 383 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  26.69 
 
 		 340 aa  85.9  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  30.14 
 
 		 327 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  28.18 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  28.24 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  26.25 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  29.02 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  27.7 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  30.49 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  28.37 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  29.87 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  29.87 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  31.39 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  28.86 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  29 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.25 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  29.26 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  29.14 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  30.09 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  26.89 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  26.87 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  36.88 
 
 		 564 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  27.8 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  30.97 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  25.62 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  33.16 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  26.92 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  23.95 
 
 		 408 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  28.95 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  27.64 
 
 		 660 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  24.12 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.85 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  26.76 
 
 		 629 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  26.76 
 
 		 647 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  26.81 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  25.07 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  25.33 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  36.36 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  30.3 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  27.02 
 
 		 637 aa  59.3  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  28.41 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  27.18 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  31.9 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  27.61 
 
 		 690 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  24.23 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  25.33 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  25.55 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  27.27 
 
 		 640 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  26.42 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.97 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  23.71 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  26.14 
 
 		 658 aa  56.2  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  22.91 
 
 		 660 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  25.52 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  26.28 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  31.08 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  25 
 
 		 383 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  24.38 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  24.54 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  28.37 
 
 		 671 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  25.78 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>