50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0486 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0486  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  31.76 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4978  acyltransferase 3  28.53 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2149  acyltransferase 3  28.29 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  25.48 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0719  acyltransferase-like protein  26.17 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.838666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  25.8 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  28.27 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  29.95 
 
 		 410 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  29.95 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  28.57 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  26.58 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  26.94 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  26.87 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6303  acyltransferase 3  29.72 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  29.1 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2427  acyltransferase 3  29.76 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0841199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  32.69 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  28.25 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4607  acyltransferase 3  27.18 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1075  acyltransferase 3  26.14 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.636973  normal  0.239028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  30.51 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27.39 
 
 		 638 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0243  acyltransferase family protein  30.88 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3554  acyltransferase 3  25.92 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4392  acyltransferase 3  25.92 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691457  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3975  acyltransferase 3  25.92 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  32 
 
 		 384 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  26.59 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2110  acyltransferase 3  29.81 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275227  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  31.01 
 
 		 632 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  26.65 
 
 		 658 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 371 aa  46.6  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  27.22 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  32.18 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  25.98 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  23.08 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  27.01 
 
 		 662 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  23.08 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  23.08 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  23.08 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1721  acyltransferase  27.64 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653575  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  25.76 
 
 		 352 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1900  hypothetical protein  27.64 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  26.92 
 
 		 362 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1744  acyltransferase  27.64 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0787383  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  26.57 
 
 		 660 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  25.51 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  29.23 
 
 		 643 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  27.02 
 
 		 363 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>