More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2002 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  100 
 
 
382 aa  743    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3660  acyltransferase 3  41.64 
 
 
387 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0530  acyltransferase 3  39.19 
 
 
367 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0289106  hitchhiker  0.0000187982 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  31.68 
 
 
604 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  32.58 
 
 
382 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  32.85 
 
 
382 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  29.6 
 
 
383 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  31.93 
 
 
645 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  29.18 
 
 
629 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  32.29 
 
 
402 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  32.06 
 
 
634 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  32.22 
 
 
675 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  30.57 
 
 
688 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  31.62 
 
 
637 aa  99.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  30.93 
 
 
716 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  31.96 
 
 
654 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.37 
 
 
639 aa  99.8  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  30.33 
 
 
671 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  28.8 
 
 
383 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  30.19 
 
 
621 aa  99.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  28.68 
 
 
408 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  31.51 
 
 
690 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  31.63 
 
 
684 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  39.24 
 
 
380 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  34.77 
 
 
402 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  26.99 
 
 
603 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  26.99 
 
 
603 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  29.67 
 
 
383 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  28.76 
 
 
690 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  31.88 
 
 
681 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  24.79 
 
 
640 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  30.28 
 
 
605 aa  95.1  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  30.79 
 
 
642 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  31.28 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  30.32 
 
 
734 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  30.51 
 
 
660 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  28.31 
 
 
607 aa  93.6  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  30.47 
 
 
383 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  30.47 
 
 
383 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  32.51 
 
 
632 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  30.77 
 
 
777 aa  93.2  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  33.12 
 
 
339 aa  92.8  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  31.13 
 
 
683 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  30.65 
 
 
759 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  30.11 
 
 
641 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  29.26 
 
 
643 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  37.81 
 
 
711 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  31.12 
 
 
682 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28 
 
 
656 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  34.62 
 
 
656 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  31.54 
 
 
715 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.57 
 
 
695 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  30.53 
 
 
625 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  37.37 
 
 
720 aa  89.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  42.31 
 
 
381 aa  87  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  29.61 
 
 
720 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  30.59 
 
 
645 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  29.72 
 
 
656 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  29.81 
 
 
665 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  30.68 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  27.3 
 
 
651 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  31.74 
 
 
667 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  28.17 
 
 
660 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  37.79 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  29.66 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  31.23 
 
 
660 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  28.82 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  33.52 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  31.49 
 
 
662 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  27.42 
 
 
690 aa  84.3  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  28.06 
 
 
675 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  29.14 
 
 
636 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  36.78 
 
 
625 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15740  predicted acyltransferase  32.05 
 
 
719 aa  83.6  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  39.64 
 
 
638 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  30.69 
 
 
742 aa  83.2  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  31.71 
 
 
716 aa  83.2  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  36.42 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.65 
 
 
616 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  29.77 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  35.8 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  30.75 
 
 
671 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  31.48 
 
 
685 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  26.4 
 
 
604 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  26.4 
 
 
604 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  33.96 
 
 
658 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05810  predicted acyltransferase  28.12 
 
 
705 aa  82.4  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.550505  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  31.27 
 
 
671 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  32.12 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  27.55 
 
 
660 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  28.7 
 
 
647 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  35.14 
 
 
660 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  28.9 
 
 
629 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  29.07 
 
 
652 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  31.44 
 
 
632 aa  79.7  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  31.51 
 
 
679 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5206  acyltransferase 3  40 
 
 
793 aa  79.7  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236489  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  32.56 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0873  acyltransferase  26.74 
 
 
646 aa  79.7  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  30.58 
 
 
673 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>