More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1701 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  100 
 
 
690 aa  1385    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  56.76 
 
 
675 aa  697    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  40.35 
 
 
688 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  39.76 
 
 
777 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  38.08 
 
 
718 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  37.6 
 
 
720 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  38.03 
 
 
690 aa  395  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  38.69 
 
 
711 aa  392  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  36.59 
 
 
715 aa  389  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  35.2 
 
 
675 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  38.74 
 
 
682 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  36.8 
 
 
716 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0643  acyltransferase 3  38.57 
 
 
693 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3768  acyltransferase 3  37.41 
 
 
675 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0162791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  39.76 
 
 
685 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  37.8 
 
 
681 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  37.73 
 
 
726 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  37.73 
 
 
726 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  37.73 
 
 
726 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  35.83 
 
 
742 aa  359  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2135  acyltransferase 3  37.68 
 
 
646 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0620882  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  35.62 
 
 
679 aa  348  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  35.18 
 
 
675 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  35.7 
 
 
676 aa  339  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14070  predicted acyltransferase  36.6 
 
 
722 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.276314  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2881  acyltransferase 3  34.48 
 
 
684 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16522  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  33.47 
 
 
710 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3258  acyltransferase 3  38.17 
 
 
725 aa  317  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575556  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  33.47 
 
 
710 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2589  acyltransferase 3  33.33 
 
 
696 aa  309  9e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2880  acyltransferase 3  33.77 
 
 
681 aa  302  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.985615  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2787  acyltransferase 3  32.83 
 
 
731 aa  301  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3139  acyltransferase 3  32.23 
 
 
716 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3079  acyltransferase 3  32.23 
 
 
716 aa  295  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3096  acyltransferase 3  32.23 
 
 
716 aa  294  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140051  normal  0.0654687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2821  acyltransferase 3  31.1 
 
 
728 aa  293  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11597  hypothetical protein  32.55 
 
 
729 aa  289  9e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5338  acyltransferase 3  30.87 
 
 
728 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5673  acyltransferase 3  30.87 
 
 
728 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.411355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3701  acyltransferase 3  30.87 
 
 
728 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.332374  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1170  acyltransferase 3  34.14 
 
 
694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177695  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  33.62 
 
 
675 aa  283  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3862  acyltransferase 3  32.52 
 
 
694 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.354687  normal  0.0930515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3630  acyltransferase 3  31.72 
 
 
731 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4381  acyltransferase 3  33.09 
 
 
687 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.106108  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  31.72 
 
 
734 aa  270  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2588  acyltransferase 3  32.39 
 
 
681 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000354486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4330  acyltransferase 3  31.71 
 
 
711 aa  266  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26680  predicted acyltransferase  35.29 
 
 
858 aa  263  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26710  predicted acyltransferase  33.14 
 
 
691 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  31.45 
 
 
695 aa  257  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2977  acyltransferase 3  29.05 
 
 
751 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  31.79 
 
 
679 aa  253  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  29.33 
 
 
662 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  30.15 
 
 
675 aa  234  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  45.71 
 
 
720 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  27.64 
 
 
690 aa  229  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  30.03 
 
 
632 aa  226  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  31.54 
 
 
629 aa  224  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  30.82 
 
 
654 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  32.21 
 
 
665 aa  220  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  31.82 
 
 
647 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  33.5 
 
 
660 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4779  acyltransferase 3  43.06 
 
 
428 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  32.01 
 
 
642 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  29.52 
 
 
640 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  34.07 
 
 
629 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  27.31 
 
 
660 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  34.74 
 
 
684 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  31.45 
 
 
660 aa  211  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.63 
 
 
660 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  30.43 
 
 
635 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  32.42 
 
 
639 aa  209  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  34.67 
 
 
690 aa  207  5e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  31.32 
 
 
671 aa  207  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  33.76 
 
 
645 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05810  predicted acyltransferase  39.26 
 
 
705 aa  204  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.550505  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  27.53 
 
 
634 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  32.38 
 
 
637 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  29.65 
 
 
679 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  33.6 
 
 
651 aa  200  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  38.84 
 
 
695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  30.81 
 
 
662 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  27.3 
 
 
629 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  28.3 
 
 
665 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  30.17 
 
 
658 aa  194  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  43.75 
 
 
630 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  28.23 
 
 
673 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  29.83 
 
 
660 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  32.05 
 
 
645 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  27.11 
 
 
642 aa  191  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  33.19 
 
 
667 aa  191  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  28.57 
 
 
635 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  29.49 
 
 
656 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  27.54 
 
 
652 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.79 
 
 
656 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  31.58 
 
 
636 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  25.07 
 
 
696 aa  184  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  37.6 
 
 
683 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  27.45 
 
 
644 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>