More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0997 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  100 
 
 
667 aa  1359    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  75.63 
 
 
673 aa  1001    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  59.15 
 
 
643 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  47.48 
 
 
645 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  37.01 
 
 
656 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  36.98 
 
 
656 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  37.11 
 
 
629 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  37.71 
 
 
665 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  38.7 
 
 
662 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  38.96 
 
 
679 aa  360  5e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  34.26 
 
 
660 aa  343  8e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  35.39 
 
 
695 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  37.84 
 
 
662 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  34.93 
 
 
695 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  32.75 
 
 
690 aa  319  9e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  41.34 
 
 
642 aa  319  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  33.38 
 
 
683 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  35.54 
 
 
695 aa  306  6e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  34.75 
 
 
629 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  38.11 
 
 
630 aa  303  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  32.12 
 
 
642 aa  302  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  46.94 
 
 
637 aa  299  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  36.42 
 
 
671 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  34.75 
 
 
647 aa  298  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  35.16 
 
 
629 aa  297  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  33.33 
 
 
679 aa  293  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  34.02 
 
 
635 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  32.27 
 
 
632 aa  286  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  34.12 
 
 
759 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  33.08 
 
 
665 aa  280  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  32.58 
 
 
616 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  34.49 
 
 
675 aa  267  5e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  33.53 
 
 
658 aa  263  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  29.46 
 
 
657 aa  260  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  31.14 
 
 
634 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  33.63 
 
 
645 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  29.72 
 
 
657 aa  259  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  31.9 
 
 
660 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  29.81 
 
 
635 aa  256  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  31.46 
 
 
615 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  35.14 
 
 
644 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  31.42 
 
 
654 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  29.33 
 
 
640 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  30.43 
 
 
684 aa  252  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  33.08 
 
 
651 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  31.69 
 
 
660 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  34.04 
 
 
621 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  29.9 
 
 
636 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  33.58 
 
 
691 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  31.28 
 
 
690 aa  239  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  35.42 
 
 
662 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  30.49 
 
 
660 aa  233  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  35.78 
 
 
678 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  30.63 
 
 
660 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.84 
 
 
639 aa  220  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  30.39 
 
 
681 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  29.24 
 
 
614 aa  213  9e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  32.44 
 
 
647 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  34.17 
 
 
638 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  30.46 
 
 
658 aa  207  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  30.12 
 
 
626 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  30.83 
 
 
675 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  33.95 
 
 
675 aa  204  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  35.13 
 
 
603 aa  203  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  37.04 
 
 
583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  25.61 
 
 
658 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  33.55 
 
 
690 aa  194  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  30.37 
 
 
690 aa  193  7e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  34.41 
 
 
598 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  25.76 
 
 
658 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  26.85 
 
 
695 aa  191  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  26.49 
 
 
647 aa  189  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  36.64 
 
 
718 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  29.19 
 
 
682 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  29.82 
 
 
632 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  37.75 
 
 
628 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  31.61 
 
 
652 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  30.04 
 
 
777 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  30.99 
 
 
627 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  36.78 
 
 
726 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  36.78 
 
 
726 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  36.78 
 
 
726 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  35.68 
 
 
711 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  33.92 
 
 
625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  37.81 
 
 
720 aa  170  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  35.29 
 
 
720 aa  169  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  35.34 
 
 
641 aa  167  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  32.04 
 
 
604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  32.04 
 
 
604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  34.59 
 
 
679 aa  165  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  25.46 
 
 
696 aa  164  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  31.67 
 
 
685 aa  163  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  31.3 
 
 
671 aa  161  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  32.14 
 
 
607 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  32.91 
 
 
734 aa  158  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  37.05 
 
 
760 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  31.93 
 
 
603 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  31.93 
 
 
603 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3258  acyltransferase 3  30.65 
 
 
725 aa  151  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575556  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  29.39 
 
 
716 aa  151  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>