More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0040 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  100 
 
 
635 aa  1244    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  40.45 
 
 
630 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  36.49 
 
 
629 aa  337  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  31.73 
 
 
660 aa  333  7.000000000000001e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  35.47 
 
 
647 aa  333  8e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.92 
 
 
656 aa  328  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  38.21 
 
 
662 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  38.28 
 
 
679 aa  324  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  36.08 
 
 
629 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  36.17 
 
 
695 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  32.27 
 
 
690 aa  310  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  38.03 
 
 
642 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  34.68 
 
 
656 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  34.93 
 
 
695 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  38.59 
 
 
665 aa  297  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  34.47 
 
 
667 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  35.65 
 
 
671 aa  296  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  34.06 
 
 
665 aa  296  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  35.24 
 
 
683 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  36.27 
 
 
679 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  34.87 
 
 
673 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  33.68 
 
 
695 aa  290  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  35.86 
 
 
632 aa  287  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  35.26 
 
 
654 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  36.04 
 
 
645 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  37.48 
 
 
662 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  36.86 
 
 
759 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  34.22 
 
 
634 aa  283  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  32.55 
 
 
635 aa  279  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  36.28 
 
 
651 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  34.4 
 
 
675 aa  273  8.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.3 
 
 
639 aa  272  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  31.22 
 
 
629 aa  270  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  34.74 
 
 
660 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  32.24 
 
 
662 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  31.18 
 
 
645 aa  264  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  30.71 
 
 
643 aa  262  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  35.93 
 
 
684 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  35.88 
 
 
675 aa  256  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  31.7 
 
 
690 aa  254  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  37.67 
 
 
660 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  33.98 
 
 
640 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  34.11 
 
 
636 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  33.02 
 
 
658 aa  242  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.08 
 
 
616 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  34.6 
 
 
644 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.57 
 
 
660 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  32.46 
 
 
638 aa  233  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  27.41 
 
 
660 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  28.42 
 
 
647 aa  232  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  27.98 
 
 
652 aa  231  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  31.37 
 
 
615 aa  230  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  30.98 
 
 
690 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  29.73 
 
 
690 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  33.23 
 
 
637 aa  228  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  30.04 
 
 
658 aa  225  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  28.01 
 
 
642 aa  224  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  33.91 
 
 
647 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  32.88 
 
 
681 aa  221  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  32.53 
 
 
691 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  31.96 
 
 
777 aa  220  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  31.37 
 
 
627 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  30.61 
 
 
614 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  31.59 
 
 
718 aa  213  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  34.74 
 
 
621 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  32.42 
 
 
658 aa  208  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  34.96 
 
 
716 aa  206  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  32.27 
 
 
658 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  31.01 
 
 
720 aa  204  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.62 
 
 
682 aa  203  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  35.51 
 
 
657 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  27.79 
 
 
688 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  33.88 
 
 
628 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  31.02 
 
 
625 aa  199  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  32.74 
 
 
598 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  34.94 
 
 
657 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  36.81 
 
 
685 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  34.22 
 
 
603 aa  190  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  31.56 
 
 
679 aa  189  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  30.63 
 
 
711 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  28.55 
 
 
626 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  30.88 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  30.46 
 
 
632 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  29.47 
 
 
715 aa  181  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  30.91 
 
 
678 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  29.94 
 
 
676 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  25 
 
 
675 aa  174  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  36.78 
 
 
690 aa  174  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  34.22 
 
 
710 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  34.22 
 
 
710 aa  173  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  28.39 
 
 
742 aa  171  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  27.89 
 
 
675 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2881  acyltransferase 3  27.16 
 
 
684 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2135  acyltransferase 3  32.86 
 
 
646 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0620882  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2610  acyltransferase 3  28.01 
 
 
555 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  34.59 
 
 
675 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  30.4 
 
 
603 aa  164  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  30.4 
 
 
603 aa  164  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2880  acyltransferase 3  26.45 
 
 
681 aa  164  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.985615  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  31.32 
 
 
695 aa  164  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>