More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3904 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  100 
 
 
678 aa  1368    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  39.66 
 
 
644 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  37.83 
 
 
647 aa  294  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  33.33 
 
 
632 aa  287  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  31.06 
 
 
635 aa  281  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  32.63 
 
 
656 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.17 
 
 
639 aa  257  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  42.71 
 
 
667 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  31.09 
 
 
629 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  37.52 
 
 
665 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  32.33 
 
 
695 aa  252  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  33.97 
 
 
662 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  34.16 
 
 
642 aa  249  9e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  32.61 
 
 
673 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  31.09 
 
 
647 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  31.74 
 
 
629 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  32.88 
 
 
656 aa  244  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  32.78 
 
 
660 aa  243  7e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  33.51 
 
 
638 aa  242  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  29.22 
 
 
626 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  32.36 
 
 
645 aa  241  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  33.09 
 
 
671 aa  240  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  31.85 
 
 
695 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  33.9 
 
 
675 aa  234  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  33.09 
 
 
695 aa  230  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  36.3 
 
 
662 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.8 
 
 
660 aa  229  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  29.85 
 
 
640 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  31.17 
 
 
654 aa  227  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  30.85 
 
 
636 aa  226  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  31.05 
 
 
679 aa  225  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  29.32 
 
 
662 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  35.95 
 
 
637 aa  224  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  32.31 
 
 
660 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  32.2 
 
 
679 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  31.95 
 
 
645 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  28.79 
 
 
629 aa  219  8.999999999999998e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  32.67 
 
 
630 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  26.82 
 
 
660 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  38.69 
 
 
643 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  30.73 
 
 
628 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  28.14 
 
 
642 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  28.49 
 
 
652 aa  210  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  31.27 
 
 
660 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  29.82 
 
 
665 aa  209  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  30.29 
 
 
627 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  40.11 
 
 
691 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  26.72 
 
 
690 aa  203  7e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  32.38 
 
 
658 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  29.48 
 
 
634 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.66 
 
 
616 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  29.91 
 
 
614 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  28.39 
 
 
684 aa  196  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  30.44 
 
 
635 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  27.85 
 
 
657 aa  194  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  28.15 
 
 
657 aa  193  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  28.79 
 
 
615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  34.32 
 
 
625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  30.65 
 
 
683 aa  190  7e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  32.88 
 
 
658 aa  188  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  35.96 
 
 
647 aa  187  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  29.46 
 
 
651 aa  187  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  34.31 
 
 
690 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  37.67 
 
 
726 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  37.67 
 
 
726 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  37.67 
 
 
726 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  28.8 
 
 
711 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  27.58 
 
 
675 aa  178  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  29.59 
 
 
777 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  27.78 
 
 
658 aa  177  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  27.42 
 
 
658 aa  177  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  29.39 
 
 
682 aa  174  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  33.73 
 
 
759 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  29.94 
 
 
621 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  36.06 
 
 
681 aa  169  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  30.17 
 
 
675 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  30.36 
 
 
632 aa  163  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.6 
 
 
690 aa  160  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  34.37 
 
 
716 aa  158  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  32.37 
 
 
583 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  39.2 
 
 
685 aa  157  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  36.31 
 
 
675 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  27.19 
 
 
603 aa  154  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  24.93 
 
 
695 aa  154  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  26.76 
 
 
688 aa  154  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  25.83 
 
 
742 aa  152  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  35.89 
 
 
690 aa  152  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  25.36 
 
 
696 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  27.57 
 
 
734 aa  148  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  32.11 
 
 
622 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  32.61 
 
 
598 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  32.98 
 
 
720 aa  146  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  31.83 
 
 
718 aa  144  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  37.43 
 
 
720 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  33.78 
 
 
710 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  33.78 
 
 
710 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  25.15 
 
 
679 aa  137  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  34.33 
 
 
671 aa  134  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  34.52 
 
 
760 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  26.71 
 
 
604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>