More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0464 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  69.55 
 
 		 645 aa  874    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  78.64 
 
 		 660 aa  972    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  100 
 
 		 660 aa  1311    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  38.09 
 
 		 636 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  38.03 
 
 		 654 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  34.43 
 
 		 690 aa  362  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  38.78 
 
 		 651 aa  356  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  37.54 
 
 		 634 aa  349  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  35.67 
 
 		 684 aa  343  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  34.98 
 
 		 640 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  37.46 
 
 		 759 aa  327  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  40.72 
 
 		 690 aa  311  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  35.28 
 
 		 629 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  35.12 
 
 		 647 aa  296  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  30.37 
 
 		 635 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  38.43 
 
 		 629 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  33.57 
 
 		 695 aa  280  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  34.4 
 
 		 660 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  34.13 
 
 		 645 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  33.94 
 
 		 632 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  33.53 
 
 		 695 aa  269  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  34.47 
 
 		 665 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.36 
 
 		 656 aa  250  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  33.03 
 
 		 665 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  30.46 
 
 		 629 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  30.77 
 
 		 660 aa  249  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  32.7 
 
 		 673 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  35.65 
 
 		 630 aa  247  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  31.22 
 
 		 667 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  29.93 
 
 		 660 aa  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.22 
 
 		 639 aa  243  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  34.44 
 
 		 635 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  33.04 
 
 		 662 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  34.16 
 
 		 662 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  28.78 
 
 		 652 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  31.37 
 
 		 627 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  35.09 
 
 		 647 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  32.95 
 
 		 679 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  30.4 
 
 		 628 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  30.28 
 
 		 662 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  32.76 
 
 		 671 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  31.4 
 
 		 658 aa  233  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  33.8 
 
 		 683 aa  232  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  32.28 
 
 		 679 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  35.43 
 
 		 643 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  31.84 
 
 		 681 aa  227  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  32.17 
 
 		 682 aa  226  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  34.07 
 
 		 642 aa  225  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  34.34 
 
 		 637 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  31.47 
 
 		 695 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  33.5 
 
 		 690 aa  223  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  31.69 
 
 		 656 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.4 
 
 		 616 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  35.96 
 
 		 675 aa  220  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  27.75 
 
 		 642 aa  220  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  34.13 
 
 		 675 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  31.35 
 
 		 644 aa  218  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  33.19 
 
 		 691 aa  216  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  31.68 
 
 		 695 aa  212  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  30.77 
 
 		 625 aa  208  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  29.76 
 
 		 615 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  31.59 
 
 		 638 aa  203  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  33.68 
 
 		 626 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  28.64 
 
 		 647 aa  197  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  41.08 
 
 		 621 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  27.09 
 
 		 657 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.74 
 
 		 657 aa  196  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  32.61 
 
 		 678 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  28.49 
 
 		 658 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  26.82 
 
 		 614 aa  193  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  30.91 
 
 		 685 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  29.07 
 
 		 675 aa  191  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  27.94 
 
 		 658 aa  191  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  29.34 
 
 		 690 aa  190  8e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  28.09 
 
 		 658 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  29.38 
 
 		 720 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  27.9 
 
 		 715 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14070  predicted acyltransferase  30.29 
 
 		 722 aa  183  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.276314  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  28.59 
 
 		 688 aa  180  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  36.51 
 
 		 710 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  29.93 
 
 		 690 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  36.51 
 
 		 710 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  35.34 
 
 		 716 aa  177  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  30.59 
 
 		 777 aa  174  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  33.8 
 
 		 583 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  35.6 
 
 		 718 aa  171  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  27.22 
 
 		 679 aa  171  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  30.51 
 
 		 603 aa  171  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  30.85 
 
 		 711 aa  170  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  28.81 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  28.81 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  28.81 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  27.62 
 
 		 675 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  29.55 
 
 		 742 aa  167  6.9999999999999995e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  30.75 
 
 		 760 aa  166  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  33.96 
 
 		 598 aa  165  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  25.17 
 
 		 696 aa  165  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  39.26 
 
 		 734 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  33 
 
 		 675 aa  160  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  28.16 
 
 		 676 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>