More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4615 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  100 
 
 
630 aa  1239    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  38.35 
 
 
632 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  34.78 
 
 
660 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  39.87 
 
 
629 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  38.6 
 
 
695 aa  352  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  39.87 
 
 
647 aa  353  8e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  34.24 
 
 
656 aa  352  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  40.03 
 
 
635 aa  348  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  39.65 
 
 
629 aa  346  6e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  38.16 
 
 
665 aa  345  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  38.7 
 
 
695 aa  341  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  38.81 
 
 
679 aa  340  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  38.35 
 
 
662 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  38.34 
 
 
642 aa  329  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  38.63 
 
 
671 aa  328  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  38.17 
 
 
667 aa  324  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  37.85 
 
 
675 aa  319  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  37.11 
 
 
695 aa  319  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  36.67 
 
 
645 aa  316  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  37.85 
 
 
662 aa  316  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  39.26 
 
 
665 aa  313  4.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  36.43 
 
 
683 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  34.29 
 
 
629 aa  311  2.9999999999999997e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  37.35 
 
 
679 aa  309  9e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  35.62 
 
 
616 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  37.95 
 
 
673 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  32.59 
 
 
635 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  35.19 
 
 
637 aa  298  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.83 
 
 
639 aa  297  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  33.93 
 
 
643 aa  296  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  35.86 
 
 
658 aa  294  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  36.6 
 
 
654 aa  293  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  34.63 
 
 
656 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  34.36 
 
 
662 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  36.59 
 
 
651 aa  286  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  35.67 
 
 
660 aa  282  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  33.65 
 
 
615 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  36.69 
 
 
645 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  34.64 
 
 
684 aa  280  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  35.49 
 
 
691 aa  277  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  31.96 
 
 
690 aa  273  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  35.3 
 
 
660 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  34.76 
 
 
634 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  37.82 
 
 
647 aa  266  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  32.66 
 
 
636 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  33.54 
 
 
627 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  34.76 
 
 
644 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  30.24 
 
 
640 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  30.03 
 
 
660 aa  247  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  33.02 
 
 
628 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  30.59 
 
 
626 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  29.65 
 
 
660 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  30.78 
 
 
690 aa  240  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  34.97 
 
 
681 aa  239  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  35.67 
 
 
621 aa  239  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  27.58 
 
 
657 aa  237  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  27.51 
 
 
657 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  30.96 
 
 
658 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  33.88 
 
 
759 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  29.21 
 
 
658 aa  230  6e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  33.64 
 
 
777 aa  230  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  28.7 
 
 
658 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  34.71 
 
 
682 aa  228  4e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  29.19 
 
 
642 aa  224  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  29.16 
 
 
647 aa  224  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  36.24 
 
 
675 aa  223  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  31.4 
 
 
690 aa  220  5e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  35.61 
 
 
690 aa  217  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  33.64 
 
 
678 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  30.75 
 
 
583 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  35.6 
 
 
675 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  38.27 
 
 
711 aa  204  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  33.64 
 
 
632 aa  203  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  34.62 
 
 
638 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  28.64 
 
 
652 aa  201  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  41.06 
 
 
726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  41.06 
 
 
726 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  41.06 
 
 
726 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  41.44 
 
 
718 aa  198  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  29.5 
 
 
716 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  30 
 
 
715 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  27.79 
 
 
688 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  30.75 
 
 
603 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  27.32 
 
 
614 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  29.94 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  35.92 
 
 
685 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  30.56 
 
 
720 aa  184  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  25.45 
 
 
625 aa  183  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3258  acyltransferase 3  34.34 
 
 
725 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575556  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  31.27 
 
 
679 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  33.75 
 
 
671 aa  179  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  29.48 
 
 
742 aa  178  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  31.52 
 
 
760 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  26.39 
 
 
696 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2610  acyltransferase 3  27.14 
 
 
555 aa  169  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  30.67 
 
 
676 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  28.06 
 
 
675 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  40.5 
 
 
720 aa  167  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  37.05 
 
 
734 aa  167  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2135  acyltransferase 3  29.94 
 
 
646 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0620882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>