189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2610 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2610  acyltransferase 3  100 
 
 
555 aa  1145    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  31.66 
 
 
629 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  30.42 
 
 
629 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  31.23 
 
 
647 aa  177  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  28.5 
 
 
662 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  28.4 
 
 
695 aa  165  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  28.28 
 
 
675 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  25.96 
 
 
635 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  28.42 
 
 
645 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  34.4 
 
 
660 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  28.23 
 
 
679 aa  154  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  28.39 
 
 
662 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  35.02 
 
 
695 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  27.96 
 
 
630 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  26.57 
 
 
690 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  31.58 
 
 
673 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  39.27 
 
 
632 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  28.12 
 
 
667 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  27.88 
 
 
662 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  25.83 
 
 
615 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  41.36 
 
 
642 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  34.59 
 
 
684 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  24.96 
 
 
647 aa  133  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  24.74 
 
 
675 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  33.14 
 
 
651 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  25.3 
 
 
642 aa  133  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.21 
 
 
660 aa  133  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  26.43 
 
 
671 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5130  putative acyltransferase 3  36.54 
 
 
647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.13544  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  27.19 
 
 
665 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.18 
 
 
639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  27.61 
 
 
660 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  34.3 
 
 
643 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  26.15 
 
 
629 aa  131  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  26.68 
 
 
632 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.77 
 
 
640 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  24.65 
 
 
657 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  25.09 
 
 
638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  25.4 
 
 
695 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  25.71 
 
 
683 aa  127  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  24.44 
 
 
657 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  30.6 
 
 
614 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  33.08 
 
 
637 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  28.01 
 
 
635 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  32.3 
 
 
690 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  30.47 
 
 
626 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  25.08 
 
 
681 aa  125  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  34.55 
 
 
665 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  24.82 
 
 
688 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.75 
 
 
658 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  27.67 
 
 
621 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  23.51 
 
 
616 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  36.55 
 
 
636 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  27.4 
 
 
644 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  25.04 
 
 
682 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  24.35 
 
 
658 aa  117  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  26.85 
 
 
627 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  27.65 
 
 
645 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  25.39 
 
 
656 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  23.58 
 
 
711 aa  114  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.45 
 
 
656 aa  113  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  23.96 
 
 
658 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3904  putative acyltransferase  25.95 
 
 
678 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5547  acyltransferase family protein  24.86 
 
 
628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0553  acetyltransferase  31.84 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  23.24 
 
 
583 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  25.98 
 
 
676 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  24.91 
 
 
634 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  38.22 
 
 
759 aa  105  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  22.77 
 
 
777 aa  105  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  30.36 
 
 
625 aa  105  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  31.82 
 
 
691 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  23.99 
 
 
675 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  23.2 
 
 
675 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  34.67 
 
 
690 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  33.07 
 
 
690 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  24.6 
 
 
716 aa  103  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  30.27 
 
 
660 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2135  acyltransferase 3  28.53 
 
 
646 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0620882  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  32.28 
 
 
660 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  30.28 
 
 
679 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  28.18 
 
 
603 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  31.8 
 
 
652 aa  100  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  34.69 
 
 
718 aa  98.2  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  24.78 
 
 
598 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  24.64 
 
 
658 aa  95.9  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  28.36 
 
 
690 aa  95.9  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  33.06 
 
 
715 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  38.27 
 
 
685 aa  94.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  31.88 
 
 
726 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  31.88 
 
 
726 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  31.88 
 
 
726 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  33.68 
 
 
679 aa  92.4  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  22.41 
 
 
742 aa  91.3  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4330  acyltransferase 3  23.4 
 
 
711 aa  91.3  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  32.18 
 
 
622 aa  91.3  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  33.61 
 
 
720 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3768  acyltransferase 3  23.46 
 
 
675 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0162791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  27.36 
 
 
675 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  29.28 
 
 
654 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>