More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5324 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  50.73 
 
 
690 aa  660    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  100 
 
 
675 aa  1368    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  50.66 
 
 
676 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2880  acyltransferase 3  41.63 
 
 
681 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.985615  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2881  acyltransferase 3  39.94 
 
 
684 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2589  acyltransferase 3  41.18 
 
 
696 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0643  acyltransferase 3  42.54 
 
 
693 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2135  acyltransferase 3  42.33 
 
 
646 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0620882  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2588  acyltransferase 3  41.04 
 
 
681 aa  445  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000354486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3768  acyltransferase 3  39.88 
 
 
675 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0162791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4381  acyltransferase 3  39.59 
 
 
687 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.106108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  35.19 
 
 
777 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  35.63 
 
 
690 aa  349  9e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26710  predicted acyltransferase  37.03 
 
 
691 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  37.78 
 
 
675 aa  345  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  34.5 
 
 
715 aa  343  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  38.53 
 
 
685 aa  341  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26680  predicted acyltransferase  34.92 
 
 
858 aa  322  9.999999999999999e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2787  acyltransferase 3  33.61 
 
 
731 aa  320  7e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3630  acyltransferase 3  33.38 
 
 
731 aa  310  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3096  acyltransferase 3  31.91 
 
 
716 aa  308  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140051  normal  0.0654687 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3139  acyltransferase 3  31.91 
 
 
716 aa  308  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3079  acyltransferase 3  31.91 
 
 
716 aa  308  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  31.85 
 
 
688 aa  306  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  30.73 
 
 
675 aa  293  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5338  acyltransferase 3  31.13 
 
 
728 aa  290  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5673  acyltransferase 3  31.13 
 
 
728 aa  290  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.411355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3701  acyltransferase 3  31.02 
 
 
728 aa  289  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.332374  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  32.81 
 
 
720 aa  289  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2821  acyltransferase 3  31.36 
 
 
728 aa  289  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11597  hypothetical protein  31.85 
 
 
729 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1170  acyltransferase 3  33.01 
 
 
694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177695  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3862  acyltransferase 3  30.41 
 
 
694 aa  280  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.354687  normal  0.0930515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  29.74 
 
 
716 aa  279  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4330  acyltransferase 3  30.79 
 
 
711 aa  277  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  32.91 
 
 
711 aa  276  8e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2977  acyltransferase 3  31.18 
 
 
751 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  30.65 
 
 
742 aa  260  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  30.18 
 
 
718 aa  250  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  31.4 
 
 
679 aa  249  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  28.83 
 
 
710 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  28.83 
 
 
710 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.96 
 
 
682 aa  243  9e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  30.34 
 
 
681 aa  231  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3258  acyltransferase 3  33.24 
 
 
725 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575556  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  30.28 
 
 
695 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  28.89 
 
 
734 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  29.97 
 
 
675 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14070  predicted acyltransferase  39.78 
 
 
722 aa  198  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.276314  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.17 
 
 
639 aa  187  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  39.24 
 
 
720 aa  187  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  29.26 
 
 
684 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  30.18 
 
 
665 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  29.53 
 
 
660 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  27.82 
 
 
679 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  28.93 
 
 
645 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  28.57 
 
 
632 aa  175  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08780  predicted acyltransferase  38.66 
 
 
777 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292028  normal  0.139471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4779  acyltransferase 3  35.71 
 
 
428 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  24.75 
 
 
662 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  26.46 
 
 
629 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  29.89 
 
 
660 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  27.86 
 
 
642 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  30 
 
 
640 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  28.75 
 
 
629 aa  164  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  25.48 
 
 
635 aa  161  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  26.48 
 
 
675 aa  160  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  28.04 
 
 
647 aa  160  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  27.55 
 
 
662 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  25 
 
 
690 aa  159  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  28.54 
 
 
660 aa  157  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  27.9 
 
 
665 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  26.02 
 
 
683 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.55 
 
 
656 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  26.66 
 
 
695 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  26.09 
 
 
637 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  28.25 
 
 
651 aa  154  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0976  acyltransferase 3  35.26 
 
 
402 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207493  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  29.31 
 
 
656 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  27.6 
 
 
662 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  29.27 
 
 
630 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  24.57 
 
 
690 aa  150  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  25.46 
 
 
647 aa  150  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  28.92 
 
 
629 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  27.27 
 
 
695 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.15 
 
 
660 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  26.52 
 
 
644 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.79 
 
 
638 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  25.5 
 
 
657 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.59 
 
 
660 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  25.5 
 
 
657 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  28.81 
 
 
634 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  25.9 
 
 
658 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.69 
 
 
616 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  30.38 
 
 
645 aa  145  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  24.95 
 
 
625 aa  143  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  26.68 
 
 
695 aa  143  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  27.74 
 
 
635 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  26.03 
 
 
760 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  33.43 
 
 
622 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>