More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3862 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  100 
 
 		 374 aa  719    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  36.89 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  33.04 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  32.77 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  31.07 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  29.17 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  30.65 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  25.53 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  33.44 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  34.21 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  29.75 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.58 
 
 		 695 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  35 
 
 		 682 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  28.61 
 
 		 583 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  34.05 
 
 		 364 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  35.13 
 
 		 372 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  34.84 
 
 		 372 aa  102  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  32.14 
 
 		 684 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  32.11 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  43.65 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  33.15 
 
 		 645 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2885  acyltransferase 3  44.74 
 
 		 385 aa  99.4  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  40.88 
 
 		 402 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  34.13 
 
 		 656 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  30.66 
 
 		 629 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  34.83 
 
 		 629 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  33.52 
 
 		 683 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  27.97 
 
 		 604 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  31.52 
 
 		 658 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  34.69 
 
 		 647 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  27.97 
 
 		 604 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  30.11 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  31.61 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  30.33 
 
 		 656 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  29.95 
 
 		 660 aa  96.7  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.36 
 
 		 656 aa  96.3  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  33.71 
 
 		 360 aa  96.3  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  32.29 
 
 		 339 aa  96.3  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  32.62 
 
 		 671 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  30.4 
 
 		 643 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  30.98 
 
 		 658 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  31.21 
 
 		 637 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  35.76 
 
 		 681 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  33.23 
 
 		 642 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  29.71 
 
 		 357 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  37.31 
 
 		 381 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  31.3 
 
 		 632 aa  93.2  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  32.32 
 
 		 651 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  28 
 
 		 660 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  28.97 
 
 		 603 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  33.85 
 
 		 629 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  34.85 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  28.97 
 
 		 603 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  40 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  27.94 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  31.76 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.39 
 
 		 616 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  32.4 
 
 		 662 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  32.28 
 
 		 658 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  30.91 
 
 		 671 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  30.17 
 
 		 634 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  34.07 
 
 		 630 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  35.24 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  30.34 
 
 		 354 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  36.42 
 
 		 695 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  26.74 
 
 		 603 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  40.51 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1457  acyltransferase 3  42.77 
 
 		 645 aa  89.7  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  34.74 
 
 		 675 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  30.34 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  29.35 
 
 		 607 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  41.45 
 
 		 680 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  31.61 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  30.79 
 
 		 658 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  27.64 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  41.45 
 
 		 681 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  41.45 
 
 		 681 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  39.24 
 
 		 662 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  38.61 
 
 		 720 aa  88.6  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  43.14 
 
 		 685 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  32.28 
 
 		 690 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  39.29 
 
 		 710 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  39.29 
 
 		 710 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  27.67 
 
 		 602 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  30.58 
 
 		 604 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  29.62 
 
 		 679 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  30.58 
 
 		 621 aa  87.8  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  30.42 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.08 
 
 		 639 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  27.79 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  38.3 
 
 		 671 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  31.08 
 
 		 675 aa  86.3  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  27.85 
 
 		 377 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3971  acyltransferase 3  30.33 
 
 		 354 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  36.47 
 
 		 660 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  39.24 
 
 		 777 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  28.57 
 
 		 675 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  28.12 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  30.21 
 
 		 690 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3558  acyltransferase 3  31.25 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0624798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>