More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  100 
 
 
716 aa  1396    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15740  predicted acyltransferase  38.19 
 
 
719 aa  345  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221169  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3022  acyltransferase 3  41.41 
 
 
646 aa  315  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399387  hitchhiker  0.00791396 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  33.99 
 
 
641 aa  311  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  31.21 
 
 
604 aa  308  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0716  putative acyltransferase  32.82 
 
 
606 aa  294  5e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  29.35 
 
 
621 aa  291  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  35.74 
 
 
656 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  26.83 
 
 
604 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  26.83 
 
 
604 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  26.82 
 
 
605 aa  255  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  27.23 
 
 
607 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  28.66 
 
 
603 aa  254  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  28.66 
 
 
603 aa  254  5.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  27.4 
 
 
602 aa  252  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0873  acyltransferase  26.58 
 
 
646 aa  233  7.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1457  acyltransferase 3  32.66 
 
 
645 aa  220  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0298  acyltransferase 3  28.78 
 
 
603 aa  219  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.613325  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  27.01 
 
 
621 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0052  hypothetical protein  27.14 
 
 
592 aa  209  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000983267  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  30.24 
 
 
710 aa  208  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1910  acyltransferase  26.55 
 
 
607 aa  203  8e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  34.92 
 
 
635 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  25 
 
 
673 aa  200  7e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0302  acyltransferase 3  25.89 
 
 
592 aa  194  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  38.92 
 
 
381 aa  184  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  23.03 
 
 
584 aa  182  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  33.67 
 
 
671 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  33.58 
 
 
675 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  37.56 
 
 
671 aa  169  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  34.01 
 
 
977 aa  165  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  36.25 
 
 
625 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  30.89 
 
 
690 aa  164  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  38.08 
 
 
680 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  37.05 
 
 
681 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  37.05 
 
 
681 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  36.32 
 
 
671 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5206  acyltransferase 3  33.49 
 
 
793 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236489  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  31.79 
 
 
632 aa  153  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  29.95 
 
 
715 aa  153  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  31.98 
 
 
710 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  31.98 
 
 
710 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  34.01 
 
 
681 aa  150  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10112  transmembrane acyltransferase  33 
 
 
685 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3115  acyltransferase 3  33.68 
 
 
546 aa  144  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228266  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  32.23 
 
 
682 aa  144  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  30.62 
 
 
711 aa  143  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0580  acyltransferase 3  21.95 
 
 
602 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  35.4 
 
 
642 aa  142  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  31.58 
 
 
662 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  28.98 
 
 
640 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  30.18 
 
 
690 aa  139  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  31.71 
 
 
742 aa  138  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  34.07 
 
 
684 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  29.71 
 
 
716 aa  136  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  30.26 
 
 
634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  34.69 
 
 
718 aa  134  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  31.88 
 
 
675 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  30.21 
 
 
360 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  29.79 
 
 
637 aa  132  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  32 
 
 
695 aa  132  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  28.8 
 
 
654 aa  130  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  31.71 
 
 
435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05810  predicted acyltransferase  31.73 
 
 
705 aa  130  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.550505  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  38.08 
 
 
734 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  29.79 
 
 
651 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  30.53 
 
 
667 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  27.85 
 
 
660 aa  129  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  30.48 
 
 
713 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14070  predicted acyltransferase  32.8 
 
 
722 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.276314  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  30.56 
 
 
673 aa  127  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  32.64 
 
 
378 aa  127  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  31.11 
 
 
632 aa  126  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  31.02 
 
 
357 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  29.71 
 
 
660 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.49 
 
 
656 aa  125  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  37.07 
 
 
720 aa  125  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  30.32 
 
 
643 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  28.99 
 
 
660 aa  124  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  49.66 
 
 
671 aa  124  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  32.21 
 
 
679 aa  124  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  38.64 
 
 
777 aa  124  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  37.35 
 
 
720 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  32.41 
 
 
665 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  30.75 
 
 
647 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  31.6 
 
 
662 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  29.85 
 
 
690 aa  122  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  33.91 
 
 
402 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  31.2 
 
 
629 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  30.26 
 
 
645 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  28.88 
 
 
635 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  28.42 
 
 
658 aa  120  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  29.97 
 
 
627 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.66 
 
 
639 aa  120  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  38.21 
 
 
665 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  33.16 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  27.2 
 
 
636 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6141  acyltransferase 3  29.72 
 
 
799 aa  118  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  28.61 
 
 
660 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  29.11 
 
 
683 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>