257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0298 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0298  acyltransferase 3  100 
 
 
603 aa  1234    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.613325  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1910  acyltransferase  49.75 
 
 
607 aa  605  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0052  hypothetical protein  45.12 
 
 
592 aa  528  1e-148  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000983267  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0302  acyltransferase 3  28.59 
 
 
592 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  28.96 
 
 
716 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  25.37 
 
 
621 aa  173  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  27.56 
 
 
641 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  27.95 
 
 
602 aa  171  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0716  putative acyltransferase  25.72 
 
 
606 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  26.15 
 
 
603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  26.15 
 
 
603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  25.04 
 
 
621 aa  164  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  25.77 
 
 
604 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  25.17 
 
 
584 aa  155  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  25.08 
 
 
605 aa  150  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  23.76 
 
 
607 aa  141  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  26.09 
 
 
656 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  23.11 
 
 
604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  23.11 
 
 
604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  24.19 
 
 
673 aa  128  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15740  predicted acyltransferase  33.23 
 
 
719 aa  124  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221169  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  29.35 
 
 
671 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3022  acyltransferase 3  26.13 
 
 
646 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399387  hitchhiker  0.00791396 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0873  acyltransferase  27.14 
 
 
646 aa  118  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  30.16 
 
 
675 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  25.27 
 
 
632 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  28.37 
 
 
977 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  28.18 
 
 
715 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  26.61 
 
 
635 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  30.22 
 
 
716 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  30.56 
 
 
711 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  30.59 
 
 
671 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  28.18 
 
 
690 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  30.91 
 
 
671 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.53 
 
 
690 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  27.59 
 
 
777 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  28.53 
 
 
688 aa  101  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  30.56 
 
 
710 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  30.56 
 
 
710 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  24.76 
 
 
640 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  28.99 
 
 
625 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  29.28 
 
 
381 aa  100  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  29.18 
 
 
682 aa  99.4  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  28.29 
 
 
675 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  28.16 
 
 
718 aa  98.2  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5206  acyltransferase 3  27.71 
 
 
793 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236489  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1457  acyltransferase 3  30.39 
 
 
645 aa  97.8  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  27.52 
 
 
671 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  29.33 
 
 
645 aa  94.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  27.62 
 
 
632 aa  94  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  26.16 
 
 
660 aa  94  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  25.86 
 
 
742 aa  93.6  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  29.5 
 
 
685 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  28.93 
 
 
695 aa  93.6  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  29.55 
 
 
679 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  29.15 
 
 
378 aa  92.8  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  29.85 
 
 
662 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10112  transmembrane acyltransferase  28.49 
 
 
685 aa  92  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  30.56 
 
 
634 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.3 
 
 
660 aa  90.9  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  27.48 
 
 
614 aa  90.5  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  30.2 
 
 
720 aa  90.5  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  24.57 
 
 
652 aa  90.5  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.33 
 
 
660 aa  90.5  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.07 
 
 
639 aa  89  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  26.94 
 
 
656 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  28.01 
 
 
635 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  28.93 
 
 
681 aa  88.2  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  26.55 
 
 
675 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  25.21 
 
 
690 aa  88.2  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  27.16 
 
 
720 aa  87.4  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  26.72 
 
 
690 aa  87.4  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  37.59 
 
 
681 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  37.59 
 
 
680 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  27.61 
 
 
644 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  37.59 
 
 
681 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  27.41 
 
 
622 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  28.37 
 
 
657 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.59 
 
 
658 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  39.01 
 
 
683 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  27.71 
 
 
629 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.21 
 
 
656 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  26.48 
 
 
665 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14070  predicted acyltransferase  28.35 
 
 
722 aa  84.7  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.276314  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  24.54 
 
 
629 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  25.91 
 
 
679 aa  84.7  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  24.47 
 
 
660 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  29.85 
 
 
662 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  27.58 
 
 
684 aa  84.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  28.19 
 
 
651 aa  84.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  28.66 
 
 
627 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  30 
 
 
734 aa  84  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  26.78 
 
 
625 aa  84  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0580  acyltransferase 3  21.38 
 
 
602 aa  84  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.356035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  25.89 
 
 
435 aa  84  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  27.24 
 
 
657 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  26.71 
 
 
637 aa  83.2  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  26.7 
 
 
638 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  29.68 
 
 
636 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  26.73 
 
 
635 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>