79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1006 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  100 
 
 		 366 aa  735    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2427  acyltransferase 3  46.5 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0841199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0886  acyltransferase family protein  31.53 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000218499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0243  acyltransferase family protein  37.66 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.473952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6303  acyltransferase 3  29.41 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  32.29 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4978  acyltransferase 3  25.79 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  31.61 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0486  hypothetical protein  29.1 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  29.41 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  29.45 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  29.45 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  23.24 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  29.45 
 
 		 390 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4174  putative acyltransferase  24.14 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  28.77 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  25.08 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  25.3 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  28.8 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  26.55 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  23.34 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  30.27 
 
 		 398 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2023  acyltransferase 3  22.87 
 
 		 363 aa  50.1  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  29.48 
 
 		 370 aa  50.1  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  29.59 
 
 		 423 aa  49.7  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  29.37 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  29.37 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4628  hypothetical protein  24.35 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  hitchhiker  0.00905511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  27.88 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2110  acyltransferase 3  28.67 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275227  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  25.07 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  28.22 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  30.54 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  26.32 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  29.19 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  24.15 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4061  acyltransferase 3  28.83 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  30.83 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  24.59 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  26.83 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  25.42 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  30.19 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4607  acyltransferase 3  30 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  28.26 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2034  acyltransferase 3  28.4 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  27.55 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  30.67 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1185  acyltransferase 3  24.28 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  31.41 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  35.92 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3975  acyltransferase 3  29.37 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3554  acyltransferase 3  29.37 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  30.72 
 
 		 419 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4392  acyltransferase 3  29.37 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691457  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  24.44 
 
 		 528 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  27.63 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  29.89 
 
 		 641 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2149  acyltransferase 3  27.27 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  29.19 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  24.84 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  29.48 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  27.95 
 
 		 372 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3115  acyltransferase 3  30.32 
 
 		 546 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  22.89 
 
 		 710 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  22.89 
 
 		 710 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  27.22 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  30.13 
 
 		 369 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  29.53 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  28.8 
 
 		 342 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4602  acyltransferase 3  33.71 
 
 		 409 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1075  acyltransferase 3  29.66 
 
 		 396 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.636973  normal  0.239028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  32.22 
 
 		 358 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  30.68 
 
 		 376 aa  42.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0728  acyltransferase 3  33.54 
 
 		 396 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416646  normal  0.548123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1329  acyltransferase 3  29.35 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  34.31 
 
 		 354 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  28.89 
 
 		 437 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>