75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4174 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4174  putative acyltransferase  100 
 
 
373 aa  734    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  25.07 
 
 
346 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.5 
 
 
660 aa  57.4  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  29.66 
 
 
330 aa  56.6  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  24.14 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  26.82 
 
 
690 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  22.22 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1542  acyltransferase 3  27.35 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.244939  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  25.68 
 
 
366 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  28.77 
 
 
365 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  22.66 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  21.52 
 
 
584 aa  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  25.9 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  23.67 
 
 
376 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5253  hypothetical protein  35.42 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.409855 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.72 
 
 
660 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  24.53 
 
 
383 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  23.63 
 
 
377 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  26.85 
 
 
379 aa  50.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  24.25 
 
 
603 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  24.25 
 
 
603 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  32.78 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  24.24 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  27.06 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26710  predicted acyltransferase  23.56 
 
 
691 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5485  acyltransferase 3  25.82 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000220898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0747  acyltransferase 3  29.45 
 
 
316 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  24.19 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  23.94 
 
 
391 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  22.8 
 
 
382 aa  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  30.12 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  30.18 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4392  acyltransferase 3  24.07 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  27.46 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3975  acyltransferase 3  24.07 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303693  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3554  acyltransferase 3  24.07 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316473  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  22.1 
 
 
640 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  22.02 
 
 
403 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  24.47 
 
 
656 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  25.6 
 
 
626 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  37.39 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  27.49 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  26.24 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  33.12 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2110  acyltransferase 3  23.62 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.275227  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  26.24 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  25.46 
 
 
634 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  30 
 
 
676 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  31.67 
 
 
369 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2263  acyltransferase 3  29.07 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0732  hypothetical protein  29.41 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2569  acyltransferase 3  29.07 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  26.53 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  26.49 
 
 
448 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  31.67 
 
 
369 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  26.94 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1656  hypothetical protein  25.24 
 
 
356 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.725742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  25 
 
 
339 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6251  acyltransferase 3  26.87 
 
 
352 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  30.25 
 
 
587 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  25.63 
 
 
398 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  25.38 
 
 
346 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  25.79 
 
 
682 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4573  acyltransferase 3  24.62 
 
 
366 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5677  acyltransferase 3  23.9 
 
 
384 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679825  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  27.09 
 
 
393 aa  43.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  25.66 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  27.73 
 
 
423 aa  43.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  30.63 
 
 
375 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  33.79 
 
 
360 aa  43.1  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  25.5 
 
 
321 aa  42.7  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  30.63 
 
 
375 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  26.69 
 
 
395 aa  42.7  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  31.15 
 
 
382 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  30.3 
 
 
392 aa  42.7  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>