233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1080 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  100 
 
 
364 aa  722    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  38.08 
 
 
357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  33.91 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  30.36 
 
 
359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  31.71 
 
 
335 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  34.63 
 
 
340 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  35.33 
 
 
333 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  32.4 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  36.15 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  31.25 
 
 
367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  31.46 
 
 
338 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  32.9 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  29.82 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  32.69 
 
 
342 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  32.71 
 
 
356 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  30.48 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  29.55 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  33.88 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  30.77 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  34.75 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  30.5 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  29.89 
 
 
353 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  31.46 
 
 
355 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  30.54 
 
 
342 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  33.52 
 
 
366 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  34.78 
 
 
340 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  29.72 
 
 
377 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  32.51 
 
 
375 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  32.01 
 
 
367 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  33.81 
 
 
336 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  35.04 
 
 
382 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  30.86 
 
 
354 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  29.78 
 
 
337 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  31.7 
 
 
351 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  29.23 
 
 
351 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  32.48 
 
 
362 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  34.81 
 
 
354 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  30.75 
 
 
378 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  34.22 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  29.35 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  31.23 
 
 
354 aa  97.1  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  29.97 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  29.97 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.14 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  32.62 
 
 
368 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  30.56 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  28.45 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  28.2 
 
 
309 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.57 
 
 
374 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  27.3 
 
 
348 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  30.7 
 
 
356 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  30.43 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  30.07 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  31.27 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  28.78 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  28.57 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  29.49 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  26.67 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  34.12 
 
 
356 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  25.19 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  30.06 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  30.79 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  27.05 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  27.18 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  26.44 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  25.8 
 
 
369 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  36.24 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  25.97 
 
 
353 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  29.13 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0741  acyltransferase 3  29.27 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387687  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  29.36 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.9 
 
 
343 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  35.4 
 
 
564 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  26.23 
 
 
369 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  28.35 
 
 
684 aa  63.2  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  25.99 
 
 
380 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  27.2 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  26.99 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  26.87 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  30.17 
 
 
354 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  28.27 
 
 
675 aa  60.1  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  27.69 
 
 
385 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  28.75 
 
 
430 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  24.42 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27.93 
 
 
638 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  25.48 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0728  acyltransferase 3  27.93 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416646  normal  0.548123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  31.55 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  30.41 
 
 
393 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0706  acyltransferase 3  32.52 
 
 
243 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  25.66 
 
 
394 aa  56.2  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  25.14 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  34.75 
 
 
397 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  33.73 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  24 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  24.65 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  26.32 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  23.05 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  26.26 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  27.35 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>