More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0347 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  100 
 
 
430 aa  847    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  33.06 
 
 
358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  36.58 
 
 
362 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  27.58 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  32.72 
 
 
393 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  27.7 
 
 
380 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  27.68 
 
 
385 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5253  hypothetical protein  36.2 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.409855 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  31.35 
 
 
348 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6989  acyltransferase-like protein  32.76 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  40.46 
 
 
312 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  29.43 
 
 
372 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  28.64 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  28.75 
 
 
433 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  32.53 
 
 
420 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  28.46 
 
 
395 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  29.32 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  29.32 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  29.32 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  31.15 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  31.17 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  31.37 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  26.34 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  30.93 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.62 
 
 
695 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  37.56 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  29.6 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  30.98 
 
 
392 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  29.43 
 
 
372 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  28.2 
 
 
391 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  27.16 
 
 
436 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  33.15 
 
 
584 aa  73.9  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3191  acyltransferase 3  27.62 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  28.05 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  23.64 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  28.75 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  28.75 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  28.41 
 
 
638 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  24.29 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.9 
 
 
690 aa  69.7  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  30.29 
 
 
679 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  26.48 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  28.84 
 
 
637 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  32.67 
 
 
630 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  37.82 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  22.08 
 
 
383 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  24.46 
 
 
366 aa  67  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  28.14 
 
 
397 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  30.09 
 
 
642 aa  66.6  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  28.25 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  26.95 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  31.21 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  27.18 
 
 
382 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  28.88 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  28.99 
 
 
662 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  27.35 
 
 
356 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  29.07 
 
 
384 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  30.65 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  27.58 
 
 
690 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  28.93 
 
 
382 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  30.89 
 
 
389 aa  63.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  24.03 
 
 
640 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  22.04 
 
 
660 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  28.33 
 
 
716 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  31.35 
 
 
340 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  27.63 
 
 
671 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  27.74 
 
 
418 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0976  acyltransferase 3  28.02 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207493  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  22.04 
 
 
660 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  29.33 
 
 
675 aa  62  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  31.22 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  35.17 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  26.88 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  25.16 
 
 
371 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  26.88 
 
 
375 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  36.48 
 
 
383 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.93 
 
 
377 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  26.88 
 
 
375 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  27.45 
 
 
353 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  27.95 
 
 
377 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  26.3 
 
 
634 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2067  acyltransferase 3  25.48 
 
 
400 aa  60.1  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  24.29 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  31.03 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  24.69 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  26.42 
 
 
675 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  30.7 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  24.93 
 
 
682 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  30.12 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  25.13 
 
 
386 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  24.87 
 
 
710 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  24.87 
 
 
710 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  28.62 
 
 
402 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  29.45 
 
 
665 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  29.85 
 
 
383 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  26.13 
 
 
665 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25262  predicted protein  27.32 
 
 
1062 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417576  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  26.93 
 
 
681 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  29.04 
 
 
357 aa  57  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  27.85 
 
 
688 aa  57  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>