161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0507 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  100 
 
 
312 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  46.21 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  45.58 
 
 
393 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  45.71 
 
 
362 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6989  acyltransferase-like protein  35.33 
 
 
395 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5253  hypothetical protein  43.15 
 
 
414 aa  96.3  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.409855 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  34.23 
 
 
380 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  40.46 
 
 
430 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  38.41 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  34.72 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  38.67 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  34.46 
 
 
354 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  32.68 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  35.62 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  36.73 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  31.11 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2997  acyltransferase 3  34.97 
 
 
409 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  32.57 
 
 
387 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  32.57 
 
 
387 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  32.57 
 
 
387 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  31.71 
 
 
348 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  33.9 
 
 
396 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4469  acyltransferase 3  34.78 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  36.42 
 
 
392 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  30.99 
 
 
383 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  31.45 
 
 
419 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  25.48 
 
 
584 aa  57.4  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  33.73 
 
 
436 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  30.86 
 
 
391 aa  56.2  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.57 
 
 
343 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  31.58 
 
 
404 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  30.23 
 
 
401 aa  56.2  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1222  acyltransferase 3  36.13 
 
 
396 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1239  acyltransferase 3  36.13 
 
 
396 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.934207  normal  0.635143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  30.41 
 
 
587 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  33.54 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  31.98 
 
 
404 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  32.43 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1249  acyltransferase 3  35.48 
 
 
404 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  31.85 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  33.33 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  33.33 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  33.33 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3191  acyltransferase 3  29.73 
 
 
378 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  30.92 
 
 
383 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  36.13 
 
 
364 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  30.34 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  30.19 
 
 
395 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  29.59 
 
 
675 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  30.87 
 
 
401 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  27.78 
 
 
366 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  30.19 
 
 
395 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  30.26 
 
 
383 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  24.4 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0251  acyltransferase 3  29.14 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  30.26 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  29.52 
 
 
392 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  29.52 
 
 
392 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0727  acyltransferase-like protein  32.21 
 
 
389 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  31.47 
 
 
564 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  31.95 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  30.17 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  29.14 
 
 
395 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  35.17 
 
 
406 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  34.36 
 
 
371 aa  50.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  31.14 
 
 
635 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  33.33 
 
 
366 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  27.85 
 
 
371 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  27.22 
 
 
656 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  30.77 
 
 
353 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11280  acyltransferase  34.81 
 
 
383 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.795947  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  29.41 
 
 
382 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  33.93 
 
 
392 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  26.75 
 
 
396 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  26.97 
 
 
394 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  27.06 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  31.36 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  27.93 
 
 
384 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0212  acyltransferase 3  28.92 
 
 
392 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.748195  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  33.12 
 
 
367 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  27.43 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  27.22 
 
 
685 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  26.95 
 
 
394 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  27.56 
 
 
375 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  30.57 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  32.34 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  28.49 
 
 
622 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25262  predicted protein  25.79 
 
 
1062 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417576  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  28.21 
 
 
671 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  32.47 
 
 
353 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  34.62 
 
 
395 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  27.57 
 
 
378 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  29.24 
 
 
403 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  29.55 
 
 
696 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  31.65 
 
 
365 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  29.59 
 
 
373 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  36.2 
 
 
448 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  33.78 
 
 
399 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  23.86 
 
 
381 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6708  acyltransferase 3  31.4 
 
 
390 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>