252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0706 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  100 
 
 
353 aa  705    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  29.95 
 
 
368 aa  109  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  30.83 
 
 
383 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  28.81 
 
 
375 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  29.18 
 
 
354 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  27.22 
 
 
395 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  27.22 
 
 
395 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  29.79 
 
 
367 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  29.22 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  28.49 
 
 
354 aa  87  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  27 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  29.39 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  27.82 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  27.95 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  27.1 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  28.73 
 
 
340 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  28.57 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  29.94 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  28.81 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  29.48 
 
 
327 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  28.66 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  29.4 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  37.01 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  26.2 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  27.07 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  26.97 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.32 
 
 
660 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  26.32 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  25.14 
 
 
373 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  35.9 
 
 
348 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  27.35 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  26.69 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  26.63 
 
 
344 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  26.69 
 
 
660 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  27.73 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  27.62 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  25.61 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  26.32 
 
 
645 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  27.8 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  25.8 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  25.27 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  25.14 
 
 
684 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  27.3 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  27.98 
 
 
356 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  23.98 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  33.93 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  25.48 
 
 
364 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  25.53 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  27.49 
 
 
364 aa  62.8  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.75 
 
 
640 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  24.27 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  27.64 
 
 
690 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  27.84 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  24.86 
 
 
690 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  28.11 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  26.05 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  29.32 
 
 
695 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  25.71 
 
 
641 aa  60.8  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  25 
 
 
396 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  27.27 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  27.3 
 
 
671 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  26.85 
 
 
378 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  31.76 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  26.39 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  25.59 
 
 
604 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  25.59 
 
 
604 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  27.39 
 
 
716 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  43.18 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  24.39 
 
 
713 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  24.39 
 
 
658 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  23.99 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  30.59 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  25.19 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  27.82 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  28.38 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  25.35 
 
 
658 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  25.93 
 
 
363 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  26.26 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  25.56 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  23.22 
 
 
384 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  27.04 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  24.74 
 
 
403 aa  56.6  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  27.72 
 
 
343 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  26.47 
 
 
675 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
714 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4563  acyltransferase 3  26.61 
 
 
363 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  25.07 
 
 
367 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  31.17 
 
 
337 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  27.95 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  33.56 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  25.14 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  32.72 
 
 
362 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  26.6 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  24.35 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  22.74 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  24.79 
 
 
658 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  24.05 
 
 
651 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  29.66 
 
 
622 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  25.7 
 
 
629 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  26.23 
 
 
690 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>