117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2067 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2067  acyltransferase 3  100 
 
 
400 aa  794    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  53.56 
 
 
401 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  34.25 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  29.86 
 
 
362 aa  110  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  28.44 
 
 
394 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  25.43 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.14 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  26.22 
 
 
350 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  25.93 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  29.9 
 
 
454 aa  63.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  31.94 
 
 
392 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  27.69 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  25.45 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  25.55 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0267  acyltransferase 3  25.96 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  26.68 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  27.5 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  22.06 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  25.52 
 
 
358 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16030  Acyltransferase 3 family protein  27.98 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  24.61 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  29.52 
 
 
360 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  25.37 
 
 
385 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  26.38 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  29.01 
 
 
380 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6951  acyltransferase-like protein  22.75 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  26.13 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  29.5 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  25.42 
 
 
587 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  24.42 
 
 
363 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  30.57 
 
 
342 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  25.75 
 
 
354 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  31.14 
 
 
383 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  31.97 
 
 
344 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  31.98 
 
 
392 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  25.71 
 
 
430 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  32.65 
 
 
344 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  23.71 
 
 
583 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2458  putative acyltransferase  26.79 
 
 
424 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4389  acyltransferase 3  30.33 
 
 
372 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3978  acyltransferase 3  30.33 
 
 
372 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642758  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  27.97 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  24.81 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  25.42 
 
 
415 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.536378 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  29.19 
 
 
660 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.59 
 
 
695 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  26.41 
 
 
368 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  25.95 
 
 
415 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  26.97 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  32.52 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  26.97 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  23.95 
 
 
353 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  29.86 
 
 
372 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  25.63 
 
 
395 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  29.19 
 
 
660 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  31.41 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4604  acyltransferase 3  29.53 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  30.24 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  29.53 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  22.91 
 
 
348 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  23.95 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  25.66 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  26.67 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  26.24 
 
 
380 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  27.41 
 
 
354 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  25.72 
 
 
404 aa  47.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  28.51 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  29.34 
 
 
359 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  25.23 
 
 
368 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  23.38 
 
 
379 aa  47  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  30.06 
 
 
383 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  30.19 
 
 
355 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  28.76 
 
 
327 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  24.14 
 
 
373 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  27.41 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  30.07 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  25.71 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  25.71 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  25.71 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  32 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  29.48 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  23.42 
 
 
376 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6866  acyltransferase 3  30.66 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  21.76 
 
 
389 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  32.16 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  24.93 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3031  acyltransferase 3  24.1 
 
 
438 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  28.07 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  25.62 
 
 
392 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  25.12 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  27.32 
 
 
375 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  29.18 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2997  acyltransferase 3  25 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  25.3 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  30.89 
 
 
632 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  26.18 
 
 
367 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  27.46 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  26.84 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2107  acyltransferase 3  29.83 
 
 
372 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.278583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  22.98 
 
 
351 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>