286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4359 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  100 
 
 
478 aa  937    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  38.48 
 
 
395 aa  193  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  39.38 
 
 
448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  36.51 
 
 
436 aa  182  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  38.64 
 
 
404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  38.19 
 
 
404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  37.47 
 
 
407 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  37.47 
 
 
407 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  37.47 
 
 
407 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  28.78 
 
 
433 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  33.91 
 
 
356 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  31.08 
 
 
367 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  34.37 
 
 
365 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  30.13 
 
 
365 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  27.42 
 
 
385 aa  89.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  28.61 
 
 
371 aa  89.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  32.96 
 
 
391 aa  87  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  22.34 
 
 
383 aa  86.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  28.98 
 
 
402 aa  86.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  30.86 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  27.95 
 
 
389 aa  79.7  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  31.69 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  31.69 
 
 
387 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  31.09 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  29.85 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  27.45 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  29.21 
 
 
388 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  29.48 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  26.87 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  30.2 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  29.16 
 
 
359 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  21.65 
 
 
584 aa  68.9  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  26.22 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  31.5 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  28.79 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  29.55 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  31.49 
 
 
312 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  24.38 
 
 
392 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  29.72 
 
 
695 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  30.41 
 
 
419 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  25.74 
 
 
679 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  27.35 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  22.73 
 
 
603 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  24.71 
 
 
640 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  24.71 
 
 
622 aa  63.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  29.4 
 
 
396 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27.29 
 
 
638 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  25.51 
 
 
621 aa  62.4  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  24.48 
 
 
415 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  23.99 
 
 
380 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  26.03 
 
 
346 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  25.53 
 
 
349 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  26.3 
 
 
382 aa  61.2  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  25.74 
 
 
656 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  24.06 
 
 
602 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  30.33 
 
 
356 aa  60.1  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0023  hypothetical protein  24.63 
 
 
373 aa  60.1  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  25.85 
 
 
716 aa  60.1  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0020  hypothetical protein  24.63 
 
 
373 aa  60.1  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234313  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  29.94 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  27.13 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  27.35 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  26.58 
 
 
392 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  23.83 
 
 
382 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  26.58 
 
 
392 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  26.85 
 
 
401 aa  60.1  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  38.14 
 
 
354 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  27.02 
 
 
368 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  24.62 
 
 
367 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  29.53 
 
 
681 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0034  acyltransferase 3  26.1 
 
 
378 aa  59.3  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  25.84 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  26.2 
 
 
665 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2651  acyltransferase 3  27.12 
 
 
363 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  26 
 
 
361 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  30.54 
 
 
402 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4464  acyltransferase 3  28.97 
 
 
404 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  26.73 
 
 
625 aa  57.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  27.51 
 
 
715 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  24.66 
 
 
696 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  22.79 
 
 
372 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  24.18 
 
 
660 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  28.23 
 
 
378 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  28.33 
 
 
377 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  28.57 
 
 
398 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  28.09 
 
 
614 aa  57  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  25.14 
 
 
354 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  29.79 
 
 
353 aa  57  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  27.65 
 
 
348 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  24.23 
 
 
353 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  27.84 
 
 
370 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  27.93 
 
 
642 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  27.18 
 
 
362 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2569  acyltransferase 3  27.32 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  27.78 
 
 
392 aa  55.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.48 
 
 
616 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  27.35 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  35.2 
 
 
384 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  25.18 
 
 
383 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  27.35 
 
 
376 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>