110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4291 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  100 
 
 		 380 aa  760    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  83.03 
 
 		 403 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  31.3 
 
 		 420 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5253  hypothetical protein  35.41 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  33.16 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6989  acyltransferase-like protein  33.64 
 
 		 395 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  29.5 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3191  acyltransferase 3  29.25 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  26.92 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  28.24 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  28.45 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  34.23 
 
 		 312 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  30.25 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  24.37 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  24.69 
 
 		 681 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  26.47 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  24.61 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  25.62 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  28.39 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  26.54 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  26.36 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  26.51 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  26.95 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  25.29 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  28.65 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  25.85 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  22.5 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  24.56 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  26.12 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  23.95 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  26.32 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  26.11 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  22.4 
 
 		 682 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  26.77 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3016  acyltransferase 3  26.46 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  24.83 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  22.17 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  27.6 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  21.17 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  24.87 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  23.4 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  21.08 
 
 		 394 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  25.13 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  22.66 
 
 		 349 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  23.15 
 
 		 357 aa  53.1  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  25 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  25 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  23.77 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  25 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  23.89 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  22.11 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.536378 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  24.49 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  23.08 
 
 		 690 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  26.71 
 
 		 676 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  23.74 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26710  predicted acyltransferase  22.6 
 
 		 691 aa  50.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  23.53 
 
 		 641 aa  50.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  23.56 
 
 		 657 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.79 
 
 		 354 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  25.08 
 
 		 364 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4174  putative acyltransferase  22.46 
 
 		 373 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  23.82 
 
 		 598 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  21.88 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  21.89 
 
 		 378 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  26.14 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  23.81 
 
 		 688 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0557  acyltransferase 3  25.1 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.972582  normal  0.853179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  22.05 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  23.3 
 
 		 657 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  36 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  21.57 
 
 		 690 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  23.39 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  26.22 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  22.28 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  24.17 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  23.17 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  23.17 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  22.86 
 
 		 675 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  22.03 
 
 		 660 aa  46.6  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  24.41 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0420  acyltransferase 3  26.67 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.58013  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  30.67 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  30.11 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  23.13 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4185  acyltransferase 3  22.89 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  22.58 
 
 		 710 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  22.25 
 
 		 603 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  22.58 
 
 		 710 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  23.85 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  30.36 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2263  acyltransferase 3  23.61 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0326627  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0036  acyltransferase 3  32.32 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  22.5 
 
 		 690 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  22.57 
 
 		 658 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  22.02 
 
 		 346 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  24.68 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.07 
 
 		 640 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0302  acyltransferase 3  20.28 
 
 		 592 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  26.47 
 
 		 368 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5160  acyltransferase 3  22.03 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>