More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1419 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  83.55 
 
 
377 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  100 
 
 
377 aa  750    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  25.77 
 
 
603 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  25.77 
 
 
603 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  31.8 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  28.05 
 
 
607 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  26.96 
 
 
673 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  27.61 
 
 
392 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  30.63 
 
 
382 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.84 
 
 
629 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.84 
 
 
647 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.91 
 
 
657 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.57 
 
 
657 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  28.07 
 
 
383 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  29.9 
 
 
435 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  26.37 
 
 
360 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.65 
 
 
656 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  24.69 
 
 
604 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  24.69 
 
 
604 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  28.76 
 
 
641 aa  100  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  28.53 
 
 
658 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  29.63 
 
 
660 aa  99.8  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  27.64 
 
 
383 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  30.18 
 
 
675 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  26.06 
 
 
602 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  29.02 
 
 
629 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  27.9 
 
 
658 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.4 
 
 
695 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.48 
 
 
616 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  27.64 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  30.1 
 
 
379 aa  97.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  30.63 
 
 
402 aa  96.3  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  29.43 
 
 
667 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  29.51 
 
 
711 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  30.41 
 
 
621 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  29.66 
 
 
640 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  28.39 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  26.18 
 
 
622 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  30.93 
 
 
671 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  29.81 
 
 
637 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  29.69 
 
 
675 aa  93.2  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  26.48 
 
 
386 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  28.32 
 
 
621 aa  92.8  8e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  28.08 
 
 
376 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  28.31 
 
 
367 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  28.79 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  30.3 
 
 
630 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  28.97 
 
 
656 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  28.32 
 
 
690 aa  90.5  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  29.55 
 
 
673 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  26.1 
 
 
696 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  26.83 
 
 
383 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  26.83 
 
 
383 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  31.74 
 
 
679 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  28.98 
 
 
662 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  26.26 
 
 
665 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  29.13 
 
 
690 aa  88.6  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  27.37 
 
 
642 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  27.13 
 
 
690 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  26.83 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  30.51 
 
 
675 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  28.2 
 
 
695 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  30.18 
 
 
683 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  27.39 
 
 
662 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  29.25 
 
 
406 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  27.35 
 
 
615 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  30.03 
 
 
642 aa  86.3  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  27.46 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  27.3 
 
 
632 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  27.3 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  28.62 
 
 
645 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  25.4 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.87 
 
 
660 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  27.87 
 
 
671 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  27.22 
 
 
643 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  31.1 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  26.51 
 
 
660 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  28.42 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  29.66 
 
 
716 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.74 
 
 
639 aa  83.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  24.08 
 
 
603 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  25.74 
 
 
625 aa  83.6  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  33.33 
 
 
710 aa  83.6  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  28.11 
 
 
604 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  27.24 
 
 
658 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0069  acyltransferase 3  28.18 
 
 
652 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000569017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  28.65 
 
 
695 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  26.23 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  28.53 
 
 
635 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  29.22 
 
 
662 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5281  hypothetical protein  32.04 
 
 
644 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.458254  normal  0.151011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  30.83 
 
 
587 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  31.28 
 
 
718 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  30.28 
 
 
665 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  29.23 
 
 
679 aa  81.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  26.97 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  28.27 
 
 
632 aa  80.5  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  30.28 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  28.88 
 
 
638 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  29.04 
 
 
759 aa  80.1  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>