More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2761 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  100 
 
 
385 aa  765    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  35.71 
 
 
372 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  29.79 
 
 
363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0891  acyltransferase 3  28.42 
 
 
392 aa  90.9  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  28.72 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  29.41 
 
 
358 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  28.61 
 
 
371 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3459  acyltransferase 3  28.43 
 
 
420 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  26.01 
 
 
401 aa  86.3  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  28.75 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  26.84 
 
 
660 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  26.84 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0347  acyltransferase 3  26.63 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.994465  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  28.36 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  26.97 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  26.09 
 
 
598 aa  80.9  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  26.3 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  25 
 
 
641 aa  79.7  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  26.8 
 
 
366 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  28.05 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  28.57 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  26.51 
 
 
660 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  26.89 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  27.45 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  23.86 
 
 
380 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  26.74 
 
 
407 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  26.74 
 
 
407 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  26.74 
 
 
407 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  27.13 
 
 
675 aa  77  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  26.39 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  28.02 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  23.72 
 
 
621 aa  74.3  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0507  acyltransferase 3  38.67 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  25.35 
 
 
604 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  25.35 
 
 
604 aa  73.6  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  23.56 
 
 
403 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  25.65 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  25.68 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3191  acyltransferase 3  27.93 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.300481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5253  hypothetical protein  28.47 
 
 
414 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.409855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  25.06 
 
 
662 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  24.48 
 
 
603 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  24.48 
 
 
603 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  26.33 
 
 
625 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  26.38 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  34.71 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  25.61 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  26.57 
 
 
368 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  25.93 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  23.62 
 
 
675 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  25.25 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  26.72 
 
 
632 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  24.27 
 
 
602 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  23.87 
 
 
584 aa  64.7  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  34.01 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  24.09 
 
 
690 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  27.66 
 
 
679 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  27.44 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  25.97 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  26.26 
 
 
635 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1288  acyltransferase 3  30.58 
 
 
423 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.463574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  26.43 
 
 
364 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6989  acyltransferase-like protein  30.06 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.27 
 
 
640 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  24.27 
 
 
607 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  27.73 
 
 
397 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4779  acyltransferase 3  24.04 
 
 
428 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  26.91 
 
 
383 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  25.22 
 
 
642 aa  63.2  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  26.68 
 
 
681 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  23.9 
 
 
604 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  26.13 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2832  acyltransferase 3  35.33 
 
 
383 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  36.42 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3532  acyltransferase 3  24 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346868  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  24.23 
 
 
629 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.08 
 
 
656 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  26.93 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  24.8 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  24.54 
 
 
583 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  26.38 
 
 
660 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3768  acyltransferase 3  23.96 
 
 
675 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0162791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0222  acyltransferase 3  24.94 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0232  acyltransferase 3  24.94 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0182056  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  28.07 
 
 
696 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  24.5 
 
 
373 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  26.6 
 
 
391 aa  60.8  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  25.07 
 
 
676 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  31.18 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  26.58 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  24.07 
 
 
716 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  25.25 
 
 
413 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  23.66 
 
 
346 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  23.95 
 
 
638 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  29.48 
 
 
403 aa  59.7  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  27.32 
 
 
371 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  25.38 
 
 
383 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  36.84 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  26.33 
 
 
671 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>