262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0601 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  100 
 
 		 353 aa  715    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  58.86 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2446  acyltransferase 3  29.79 
 
 		 404 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  29.17 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  30.38 
 
 		 419 aa  86.3  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  25.24 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  29.66 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.28 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  26.02 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  28.8 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  28.88 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  28.88 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  28.88 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  27.53 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  29.04 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  28.02 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  28.94 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4357  acyltransferase 3  29.71 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430894  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  28.37 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  28.21 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  26.68 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  31.38 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  24.81 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  28.14 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  25.68 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  26.05 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0303  acyltransferase 3  28.83 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  27.79 
 
 		 665 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  26.89 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  28.3 
 
 		 671 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  28.53 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  25 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  31.11 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  32.16 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.43 
 
 		 639 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.44 
 
 		 656 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  28.77 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  30.56 
 
 		 675 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  27.42 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  27.22 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  29.04 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  28.53 
 
 		 679 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  28.85 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  28.17 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  35.03 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  31.64 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  28.17 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  26.87 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  28.17 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  27.51 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  26.45 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  43.66 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  43.66 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  26.86 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  28.01 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  27.22 
 
 		 716 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  41.25 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  31.88 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  27.91 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  27.45 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  26.69 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  27.91 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  31.48 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  27.22 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  22.11 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  23.58 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  26.33 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  29.01 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  27.35 
 
 		 658 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  26.37 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  27.92 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  27.3 
 
 		 675 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  28.94 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  31.25 
 
 		 598 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  33.76 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  24.38 
 
 		 673 aa  56.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  29.34 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  25.28 
 
 		 660 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  28.62 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  28.12 
 
 		 629 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  30.46 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.21 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 647 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  27.55 
 
 		 382 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  28.66 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  41.67 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  29.02 
 
 		 398 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  26.1 
 
 		 695 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  29.22 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  27.27 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  26.22 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  39.33 
 
 		 377 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  27.6 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  28.34 
 
 		 690 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  27.35 
 
 		 637 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  27.68 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  33.77 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  25.57 
 
 		 635 aa  53.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  37.23 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  29.09 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0543721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>