207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3909 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3909  putative acyltransferase  100 
 
 
414 aa  831    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.400096  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2446  acyltransferase 3  36.7 
 
 
404 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  31.14 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  33.02 
 
 
419 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  32.44 
 
 
349 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  31.78 
 
 
371 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  30.69 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  29.51 
 
 
392 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  29.05 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  28.68 
 
 
358 aa  93.2  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  34.01 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2329  acyltransferase 3  30.09 
 
 
367 aa  90.5  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.343174  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  29.07 
 
 
356 aa  89.7  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  24.74 
 
 
383 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  26.32 
 
 
378 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  28.7 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  25.54 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  27.38 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0243  acyltransferase 3  27.54 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113037  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  27.97 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  28.49 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  36.67 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  28.19 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  33.54 
 
 
372 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  29.52 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  26.72 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  26.09 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  28.01 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  29.13 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  28.21 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  27.78 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  24.29 
 
 
370 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  34.72 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4314  acyltransferase 3  28.92 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  24.74 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  24.74 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  24.74 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0303  acyltransferase 3  27.48 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  25.13 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  32.47 
 
 
433 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1980  acyltransferase 3  44.05 
 
 
352 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  27.22 
 
 
583 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  26.23 
 
 
656 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  25.71 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  28.05 
 
 
330 aa  64.3  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  25.93 
 
 
377 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0938  acyltransferase 3  31.55 
 
 
364 aa  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  32.11 
 
 
360 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0091  acyltransferase-like protein  33.33 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  26.09 
 
 
667 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4960  acyltransferase 3  31.1 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000847254  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  25.25 
 
 
371 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  25.98 
 
 
393 aa  59.7  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  24.93 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  28.03 
 
 
683 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  23.76 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  30.12 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  24.12 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  26.76 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.71 
 
 
639 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2879  hypothetical protein  22.62 
 
 
379 aa  57.4  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  29.61 
 
 
584 aa  57  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  40 
 
 
374 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0531  acyltransferase 3  40.51 
 
 
342 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1849  acyltransferases-like  30.86 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  25 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27 
 
 
638 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  25.83 
 
 
662 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  30.2 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  26.75 
 
 
350 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  24.38 
 
 
616 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  24.17 
 
 
362 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2034  acyltransferase 3  26.44 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544666  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  25.91 
 
 
372 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  25.07 
 
 
675 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  37.35 
 
 
382 aa  53.1  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  22.94 
 
 
658 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  24.7 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  35.85 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  24.32 
 
 
478 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  30.34 
 
 
362 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  28.93 
 
 
383 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2765  acyltransferase 3  32.92 
 
 
392 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142535  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  24.51 
 
 
587 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  30.23 
 
 
622 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  22.73 
 
 
691 aa  51.2  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25262  predicted protein  31.06 
 
 
1062 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417576  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  23.82 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1392  acyltransferase 3  30.85 
 
 
369 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  35.71 
 
 
376 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  25.4 
 
 
354 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4988  acyltransferase family 3 protein  30.38 
 
 
395 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  30.77 
 
 
696 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  24.7 
 
 
380 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  34.55 
 
 
710 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  36.36 
 
 
673 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  37.5 
 
 
381 aa  50.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  28.66 
 
 
396 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  33.66 
 
 
660 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  27.64 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>