More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0631 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  100 
 
 
360 aa  713    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  29.95 
 
 
392 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  43.17 
 
 
377 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  33.24 
 
 
360 aa  119  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  34.63 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  29.79 
 
 
386 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  31.25 
 
 
637 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  32.43 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  29.89 
 
 
346 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  34.29 
 
 
376 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  31.09 
 
 
435 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  29.83 
 
 
369 aa  109  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  29.52 
 
 
621 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4604  acyltransferase 3  31.69 
 
 
372 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4389  acyltransferase 3  30.41 
 
 
372 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  32.69 
 
 
616 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3978  acyltransferase 3  30.41 
 
 
372 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642758  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  31.42 
 
 
625 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  30.41 
 
 
372 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  36.52 
 
 
367 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.69 
 
 
629 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  29.67 
 
 
339 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.69 
 
 
647 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  32.39 
 
 
362 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.37 
 
 
377 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  30.1 
 
 
671 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  29.17 
 
 
377 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  33.7 
 
 
418 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  32.28 
 
 
660 aa  102  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  29.92 
 
 
388 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  33.77 
 
 
376 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  30.6 
 
 
671 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  38.04 
 
 
635 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6049  acyltransferase 3  33.06 
 
 
423 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  28.65 
 
 
603 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  28.65 
 
 
603 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  34.07 
 
 
642 aa  99.8  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  31.89 
 
 
632 aa  99  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  33.13 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  30.98 
 
 
695 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  28.12 
 
 
366 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  28.45 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  29.97 
 
 
629 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  27.25 
 
 
396 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  42.11 
 
 
656 aa  97.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  32.92 
 
 
630 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  40.91 
 
 
671 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  32.33 
 
 
760 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  40.35 
 
 
667 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  26.96 
 
 
376 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  32.88 
 
 
675 aa  95.9  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  38.75 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  28.61 
 
 
406 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2107  acyltransferase 3  30.33 
 
 
372 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.278583 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  29.7 
 
 
615 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  42.86 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  30.16 
 
 
662 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  27.97 
 
 
604 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  38.22 
 
 
671 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  31.3 
 
 
342 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3369  acyltransferase 3  30.6 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  32.9 
 
 
640 aa  92.8  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  35.68 
 
 
690 aa  92.8  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  37.3 
 
 
679 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0700  acyltransferase family protein  30.81 
 
 
437 aa  92.4  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.926657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  38.55 
 
 
673 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  26.29 
 
 
393 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  32.65 
 
 
675 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  29.58 
 
 
684 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  34.84 
 
 
665 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  33.64 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  28.97 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  30.52 
 
 
658 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  37.31 
 
 
977 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  32.68 
 
 
662 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.11 
 
 
695 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  37.42 
 
 
632 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4185  acyltransferase 3  28.5 
 
 
397 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  31.02 
 
 
656 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3871  acyltransferase 3  30.6 
 
 
372 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.833445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  28.39 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  34.95 
 
 
665 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  35.64 
 
 
383 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  32.27 
 
 
682 aa  89.4  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  38.85 
 
 
681 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  38.85 
 
 
681 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  34.86 
 
 
607 aa  89  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  28.12 
 
 
622 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  31.61 
 
 
645 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  39.02 
 
 
365 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.77 
 
 
639 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  38.85 
 
 
680 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3115  acyltransferase 3  27.51 
 
 
546 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228266  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  27.25 
 
 
629 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  31.33 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  29.1 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  35.05 
 
 
602 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  30.83 
 
 
710 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0873  acyltransferase  25.2 
 
 
646 aa  87.8  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  37.01 
 
 
641 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>