More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4679 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  100 
 
 		 377 aa  743    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  35.31 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  30.65 
 
 		 392 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  43.81 
 
 		 360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  31.43 
 
 		 435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  30.25 
 
 		 381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  29.43 
 
 		 386 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  29.92 
 
 		 378 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  31 
 
 		 360 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4389  acyltransferase 3  33.43 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3978  acyltransferase 3  33.43 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  29.09 
 
 		 660 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  33.33 
 
 		 658 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  31.67 
 
 		 671 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  32.69 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  37.55 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  30.32 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4604  acyltransferase 3  32.04 
 
 		 372 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  33 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  29.62 
 
 		 629 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  30.57 
 
 		 690 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  30.6 
 
 		 675 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  30.75 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  26.25 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  34.29 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  28.83 
 
 		 662 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  39.04 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  46.5 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  33.23 
 
 		 679 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  28.01 
 
 		 640 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  30.69 
 
 		 690 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  29.61 
 
 		 645 aa  97.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  28.45 
 
 		 643 aa  96.7  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.17 
 
 		 695 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6049  acyltransferase 3  30.85 
 
 		 423 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2107  acyltransferase 3  29.87 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.278583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  33.44 
 
 		 675 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  33.12 
 
 		 645 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  30.3 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  35.26 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  40.76 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  31.8 
 
 		 662 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  31.39 
 
 		 665 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  32.03 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  33.86 
 
 		 681 aa  92.8  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  32.33 
 
 		 684 aa  92.8  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  34.45 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  32.58 
 
 		 695 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  31.72 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  35.8 
 
 		 660 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3369  acyltransferase 3  30.68 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  29.97 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  26.61 
 
 		 584 aa  90.9  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  38.17 
 
 		 671 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.78 
 
 		 629 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6866  acyltransferase 3  31.09 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.69 
 
 		 656 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  30.13 
 
 		 339 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  39.33 
 
 		 635 aa  90.5  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  30.28 
 
 		 604 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  30.28 
 
 		 604 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  30 
 
 		 383 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.74 
 
 		 616 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.78 
 
 		 647 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  29.03 
 
 		 598 aa  89.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  34.43 
 
 		 630 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  35.02 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  29.73 
 
 		 710 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  29.73 
 
 		 710 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3871  acyltransferase 3  40.76 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.833445 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2885  acyltransferase 3  40 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  27.59 
 
 		 603 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  28.03 
 
 		 656 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  33.23 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  33.23 
 
 		 685 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  33.23 
 
 		 695 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  26.17 
 
 		 583 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1701  acyltransferase family protein  32.37 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0550  acyltransferase family protein  32.37 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1879  acyltransferase family protein  32.37 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  42.94 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  38.98 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  40.65 
 
 		 607 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  33.44 
 
 		 621 aa  86.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  31.32 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.66 
 
 		 660 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  27.5 
 
 		 393 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0700  acyltransferase family protein  29.27 
 
 		 437 aa  86.3  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.926657  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  29.26 
 
 		 350 aa  86.3  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  31.15 
 
 		 642 aa  86.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  28.84 
 
 		 604 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1708  acyltransferase family protein  32.11 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110061  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  27.66 
 
 		 660 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0747  acyltransferase family protein  40.76 
 
 		 697 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.852579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0541  acyltransferase family protein  32.11 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1670  acyltransferase family protein  32.05 
 
 		 585 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.602851  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  27.73 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2294  putative acyltransferase  32.11 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  37.01 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1661  acyltransferase family protein  32.11 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>