More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5101 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
378 aa  763    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  52.74 
 
 
386 aa  343  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  29.02 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  30.94 
 
 
386 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  29.52 
 
 
396 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  31.35 
 
 
372 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4389  acyltransferase 3  31.09 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3978  acyltransferase 3  31.09 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642758  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  29.6 
 
 
392 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  31.25 
 
 
380 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  28.35 
 
 
381 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3369  acyltransferase 3  29.84 
 
 
372 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3871  acyltransferase 3  30.08 
 
 
372 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.833445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2107  acyltransferase 3  30.71 
 
 
372 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.278583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  30.99 
 
 
418 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  33.64 
 
 
360 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6866  acyltransferase 3  31.1 
 
 
361 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4604  acyltransferase 3  30 
 
 
372 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  30.71 
 
 
368 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  30.28 
 
 
622 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  29.37 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  31.51 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  39.08 
 
 
364 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  30 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  31.65 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  32.8 
 
 
372 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  27.27 
 
 
383 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  30.38 
 
 
366 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6049  acyltransferase 3  41.26 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3971  acyltransferase 3  30.16 
 
 
354 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181677  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  27.02 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  29.37 
 
 
365 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  27.76 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2114  acyltransferase 3  37.91 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3558  acyltransferase 3  32.15 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0624798  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  26.88 
 
 
383 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  29.49 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.39 
 
 
660 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  24.26 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  29.12 
 
 
710 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  29.12 
 
 
710 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  28.08 
 
 
660 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0700  acyltransferase family protein  25.82 
 
 
437 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.926657  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1708  acyltransferase family protein  39.41 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110061  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  28.57 
 
 
696 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1869  acyltransferase family protein  39.41 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0757  acyltransferase family protein  39.41 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156053  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0691  acyltransferase family protein  40 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244705  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2294  putative acyltransferase  39.41 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0541  acyltransferase family protein  39.41 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2433  putative acyltransferase  39.41 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142422  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1661  acyltransferase family protein  39.41 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  28.02 
 
 
435 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  31.47 
 
 
734 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  27.46 
 
 
604 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  27.46 
 
 
604 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  32.05 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  37.91 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  27.13 
 
 
656 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  28.73 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  28.73 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  25.98 
 
 
381 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  28.43 
 
 
604 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  29 
 
 
679 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  32.89 
 
 
684 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  39.13 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  28.45 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  26.81 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  27.86 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  30.77 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  28.57 
 
 
675 aa  76.3  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  37.97 
 
 
625 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2420  putative acyltransferase  35.9 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  28.11 
 
 
690 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  33.15 
 
 
658 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1701  acyltransferase family protein  35.9 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2282  putative acyltransferase  35.9 
 
 
461 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0550  acyltransferase family protein  35.9 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1879  acyltransferase family protein  35.9 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  28.53 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  25.06 
 
 
584 aa  73.2  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0747  acyltransferase family protein  35.9 
 
 
697 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.852579  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1670  acyltransferase family protein  35.26 
 
 
585 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.602851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  35.71 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.75 
 
 
656 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  25.06 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  30.22 
 
 
405 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.64 
 
 
640 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  31.61 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  37.2 
 
 
681 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  37.2 
 
 
680 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  29.19 
 
 
695 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  26.82 
 
 
695 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  37.2 
 
 
681 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  24.67 
 
 
583 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  33.12 
 
 
713 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  28.97 
 
 
695 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  26.32 
 
 
667 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  35.29 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3990  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>