More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1967 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  93.55 
 
 
372 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  100 
 
 
368 aa  728    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  82.61 
 
 
366 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  75.94 
 
 
364 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3971  acyltransferase 3  75.29 
 
 
354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181677  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  74.78 
 
 
354 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0691  acyltransferase family protein  77.22 
 
 
379 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244705  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  74.2 
 
 
354 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1708  acyltransferase family protein  75.81 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110061  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2294  putative acyltransferase  75.81 
 
 
352 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0541  acyltransferase family protein  75.81 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1661  acyltransferase family protein  75.81 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0757  acyltransferase family protein  76.11 
 
 
352 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2433  putative acyltransferase  76.11 
 
 
352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142422  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1869  acyltransferase family protein  75.81 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3558  acyltransferase 3  75.29 
 
 
354 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0624798  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4396  acyltransferase 3  75.81 
 
 
326 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2114  acyltransferase 3  75 
 
 
354 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  47.41 
 
 
346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  32.35 
 
 
392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  30.34 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  30.91 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  32.87 
 
 
660 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  32.09 
 
 
695 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  32.34 
 
 
656 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  35.1 
 
 
660 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  32.67 
 
 
662 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  33.97 
 
 
695 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  31.73 
 
 
634 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  32.97 
 
 
645 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  32.29 
 
 
696 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  33.51 
 
 
377 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  35.17 
 
 
681 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  30.63 
 
 
622 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  31.58 
 
 
660 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  30.59 
 
 
435 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  41.98 
 
 
376 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  28.91 
 
 
690 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3303  acyltransferase 3  34.13 
 
 
389 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198239  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  32.64 
 
 
382 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  30.18 
 
 
386 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  31.82 
 
 
641 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  29.16 
 
 
380 aa  99.4  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  33.33 
 
 
734 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  30.06 
 
 
710 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  33.72 
 
 
684 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  30.06 
 
 
710 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  35.67 
 
 
679 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  29.03 
 
 
629 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  30.77 
 
 
656 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.19 
 
 
616 aa  96.7  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  41.51 
 
 
376 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  32.21 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  30.19 
 
 
583 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  32.05 
 
 
638 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  30.98 
 
 
604 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  30.56 
 
 
382 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  40.91 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  34.31 
 
 
977 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  32.58 
 
 
658 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  32.65 
 
 
671 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  29.72 
 
 
690 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  34.05 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  31.61 
 
 
675 aa  93.6  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  28.71 
 
 
660 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  29.34 
 
 
660 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  32.13 
 
 
368 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  30.58 
 
 
640 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  28.24 
 
 
604 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  33.66 
 
 
630 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  30.25 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  28.24 
 
 
604 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.68 
 
 
682 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  30.94 
 
 
716 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  31.25 
 
 
383 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  29.41 
 
 
690 aa  89.7  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  30.08 
 
 
368 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  29.9 
 
 
742 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  30.84 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2885  acyltransferase 3  36.73 
 
 
385 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  36.54 
 
 
671 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  33.55 
 
 
607 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  31.52 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  31.33 
 
 
667 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  32.26 
 
 
690 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  31.21 
 
 
645 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  30.38 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  33.23 
 
 
405 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  33.23 
 
 
726 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  33.23 
 
 
726 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  26.55 
 
 
603 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  33.23 
 
 
726 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  28.72 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  29.47 
 
 
383 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  29.11 
 
 
635 aa  86.7  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  31.66 
 
 
383 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  29.47 
 
 
408 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  27.44 
 
 
366 aa  85.9  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  36.68 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  29.91 
 
 
615 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>