More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3369 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  88.98 
 
 
372 aa  634    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3369  acyltransferase 3  100 
 
 
372 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3871  acyltransferase 3  97.85 
 
 
372 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.833445 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4389  acyltransferase 3  87.9 
 
 
372 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3978  acyltransferase 3  87.9 
 
 
372 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642758  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2107  acyltransferase 3  88.17 
 
 
372 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.278583 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4604  acyltransferase 3  82.53 
 
 
372 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0700  acyltransferase family protein  64.8 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.926657  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1670  acyltransferase family protein  64.48 
 
 
585 aa  391  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.602851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1701  acyltransferase family protein  64.75 
 
 
375 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0747  acyltransferase family protein  64.75 
 
 
697 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.852579  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0550  acyltransferase family protein  64.75 
 
 
375 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1879  acyltransferase family protein  64.75 
 
 
375 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2282  putative acyltransferase  64.75 
 
 
461 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2420  putative acyltransferase  64.75 
 
 
467 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  38.06 
 
 
418 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6049  acyltransferase 3  38.8 
 
 
423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  35.62 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  30.79 
 
 
360 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  30.56 
 
 
377 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  30.99 
 
 
378 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  29.2 
 
 
637 aa  90.1  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  31.51 
 
 
679 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  30 
 
 
583 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  27.46 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  29.71 
 
 
660 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  33.87 
 
 
376 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  37.5 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  33.83 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.58 
 
 
695 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  28.53 
 
 
657 aa  83.2  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  30.35 
 
 
660 aa  83.2  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  33.69 
 
 
365 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  30.89 
 
 
718 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  33.01 
 
 
671 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  29.24 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  34.29 
 
 
642 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  29.62 
 
 
647 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  29.62 
 
 
629 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  31.38 
 
 
715 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  27.69 
 
 
658 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  29.6 
 
 
711 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  33.75 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  27.45 
 
 
607 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  26.74 
 
 
604 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  26.74 
 
 
604 aa  80.1  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  30.77 
 
 
675 aa  79.7  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  27.87 
 
 
657 aa  79.7  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  29.04 
 
 
662 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  32.2 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  27.37 
 
 
635 aa  79  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  30.22 
 
 
682 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  30.19 
 
 
658 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  26.76 
 
 
658 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  29.51 
 
 
621 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  31.13 
 
 
675 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  29.75 
 
 
679 aa  77.4  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  28.57 
 
 
685 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  27.25 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  27.18 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  33.7 
 
 
371 aa  77  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  31 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  30.63 
 
 
710 aa  76.3  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6866  acyltransferase 3  31.88 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  29.95 
 
 
629 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  31.27 
 
 
630 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  29.5 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  29.81 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  30.67 
 
 
716 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  29.25 
 
 
643 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  31.86 
 
 
690 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  31.9 
 
 
681 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  28.76 
 
 
641 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  29.49 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  29.55 
 
 
368 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3115  acyltransferase 3  29.7 
 
 
546 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  26.65 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  28.8 
 
 
604 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  28.53 
 
 
622 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  30.59 
 
 
656 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  31.13 
 
 
690 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  33.55 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  36.1 
 
 
632 aa  73.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  29.32 
 
 
634 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  29.94 
 
 
675 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  31.66 
 
 
660 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  28.83 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  30.3 
 
 
383 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  27.78 
 
 
660 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  27.37 
 
 
629 aa  72  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  29.34 
 
 
671 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2754  acyltransferase 3  33.02 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  31.95 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  31.21 
 
 
638 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  29.87 
 
 
662 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  27.3 
 
 
645 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  26.2 
 
 
603 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  34.69 
 
 
742 aa  70.1  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  31.68 
 
 
660 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  30.77 
 
 
598 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>