More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0174 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  100 
 
 
358 aa  711    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  41.6 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  38.07 
 
 
382 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  36.54 
 
 
641 aa  169  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  36.56 
 
 
671 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  34.64 
 
 
603 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  34.64 
 
 
603 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  36.18 
 
 
382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  34.51 
 
 
435 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  36.34 
 
 
402 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  36.75 
 
 
632 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  33.6 
 
 
656 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  35.22 
 
 
604 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  33.68 
 
 
977 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  33.24 
 
 
604 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  33.24 
 
 
604 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  34.55 
 
 
602 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  33.15 
 
 
607 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  34.45 
 
 
625 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  31.97 
 
 
710 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  31.97 
 
 
710 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  30.09 
 
 
339 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5206  acyltransferase 3  33.51 
 
 
793 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236489  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  31.07 
 
 
671 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  33.44 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  32.4 
 
 
657 aa  126  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.51 
 
 
695 aa  126  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  33.6 
 
 
680 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  33.87 
 
 
681 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  30.03 
 
 
671 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  33.87 
 
 
681 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  31.52 
 
 
634 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  32.04 
 
 
640 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  30.56 
 
 
660 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  30.3 
 
 
657 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  31.08 
 
 
711 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0873  acyltransferase  29.51 
 
 
646 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997874 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  30.51 
 
 
643 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  30.6 
 
 
734 aa  119  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  44.16 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  30.79 
 
 
662 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10112  transmembrane acyltransferase  31.07 
 
 
685 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  30.26 
 
 
713 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1457  acyltransferase 3  35.08 
 
 
645 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  30.7 
 
 
658 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  30.18 
 
 
690 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  32.59 
 
 
675 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  31.52 
 
 
605 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  31.65 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  30.79 
 
 
658 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15740  predicted acyltransferase  31.16 
 
 
719 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221169  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  30.62 
 
 
629 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  30.53 
 
 
647 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  32.29 
 
 
357 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  32.87 
 
 
584 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  27.73 
 
 
621 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.3 
 
 
656 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  31.96 
 
 
660 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  30.83 
 
 
690 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  29.13 
 
 
695 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  28.73 
 
 
642 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.88 
 
 
639 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  28.91 
 
 
373 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  30.97 
 
 
720 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3022  acyltransferase 3  34.65 
 
 
646 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0399387  hitchhiker  0.00791396 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0052  hypothetical protein  29.32 
 
 
592 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000983267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  30.17 
 
 
627 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  31.58 
 
 
660 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  29.14 
 
 
684 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  32.04 
 
 
660 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  31.87 
 
 
685 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  30.58 
 
 
665 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1385  acyltransferase 3  28.34 
 
 
635 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0794354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  32.15 
 
 
710 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  29.43 
 
 
671 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0412  acyltransferase 3  30.64 
 
 
621 aa  107  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00103488  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  29.38 
 
 
647 aa  106  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  30.59 
 
 
645 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  29.23 
 
 
656 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  31.28 
 
 
720 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  30.51 
 
 
695 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  30.79 
 
 
629 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  33.23 
 
 
777 aa  105  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  33.33 
 
 
635 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  30.82 
 
 
688 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  28.9 
 
 
675 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3115  acyltransferase 3  32.5 
 
 
546 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.228266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  30.23 
 
 
651 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  30.31 
 
 
673 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  29.55 
 
 
381 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  30.68 
 
 
667 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  31.9 
 
 
718 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  29.44 
 
 
682 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  31.66 
 
 
716 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  30.37 
 
 
583 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  30.48 
 
 
645 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  29.92 
 
 
635 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  29.44 
 
 
632 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  30.75 
 
 
642 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  29.01 
 
 
662 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>