More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3504 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  100 
 
 		 373 aa  753    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  35.75 
 
 		 366 aa  199  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4185  acyltransferase 3  32.65 
 
 		 397 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  26.56 
 
 		 604 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  26.56 
 
 		 604 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  28.38 
 
 		 358 aa  95.9  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  24.3 
 
 		 607 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  25.8 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  28.61 
 
 		 671 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  26.49 
 
 		 710 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  26.49 
 
 		 710 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  25.59 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  27.92 
 
 		 392 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  26.97 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  30.81 
 
 		 350 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  26.96 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  28.32 
 
 		 734 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  28.39 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  33.54 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  26.3 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  27.55 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  25.45 
 
 		 603 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  25.45 
 
 		 603 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  28.03 
 
 		 641 aa  83.6  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  25.71 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  27.3 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  25.94 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  27.44 
 
 		 681 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  32.16 
 
 		 682 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  27.89 
 
 		 671 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  34.71 
 
 		 671 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  27.68 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  29.06 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  35.63 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  35.09 
 
 		 680 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  35.09 
 
 		 681 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  35.09 
 
 		 681 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  27.49 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  36.2 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  25.36 
 
 		 690 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  27.79 
 
 		 675 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  27.88 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  35.4 
 
 		 656 aa  76.6  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  27.42 
 
 		 679 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  25.51 
 
 		 604 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10112  transmembrane acyltransferase  32.95 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  26.48 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  27.56 
 
 		 603 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6141  acyltransferase 3  32.64 
 
 		 799 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  27.78 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  27.66 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  27.11 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  28.38 
 
 		 598 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  26.46 
 
 		 602 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  25.54 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  26.72 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  25.52 
 
 		 695 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  30.91 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  24.31 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  25.93 
 
 		 651 aa  71.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  24.12 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  24.68 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  24.18 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  32.53 
 
 		 625 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  23.98 
 
 		 688 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  30.51 
 
 		 777 aa  69.3  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  35.47 
 
 		 977 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  25.47 
 
 		 684 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3898  acyltransferase 3  25.84 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0109111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  31.95 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  30.99 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5101  cyclic nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  27.25 
 
 		 621 aa  68.6  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  26.2 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  26.01 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  32.93 
 
 		 713 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  24.39 
 
 		 583 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0901  acyltransferase 3  27.95 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6049  acyltransferase 3  26.6 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  28.5 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2409  hypothetical protein  25.88 
 
 		 605 aa  66.6  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.372977  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  32.37 
 
 		 364 aa  67  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  26.52 
 
 		 718 aa  66.2  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  25.9 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0873  acyltransferase  24.24 
 
 		 646 aa  66.2  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997874 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  23.9 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  24.75 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  32.7 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3303  acyltransferase 3  28.07 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198239  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  26.49 
 
 		 695 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  26.26 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  25.07 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  23.86 
 
 		 716 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  25.51 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  25.38 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  35.98 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2754  acyltransferase 3  25.73 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  32.18 
 
 		 660 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  25.38 
 
 		 660 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  27.01 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>