More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4185 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4185  acyltransferase 3  100 
 
 
397 aa  799    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  32.12 
 
 
373 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  33.5 
 
 
366 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  33.33 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  29.17 
 
 
360 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  28.72 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  27.64 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  25.45 
 
 
365 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  36.56 
 
 
383 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  36.56 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  27.71 
 
 
386 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  28.78 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  26.92 
 
 
604 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  26.92 
 
 
604 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  29.94 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  25.37 
 
 
381 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6141  acyltransferase 3  37.5 
 
 
799 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  27.13 
 
 
607 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  26.57 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  36.18 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  34.16 
 
 
713 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  36.81 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  35.88 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  28.27 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  28.18 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2754  acyltransferase 3  32.6 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  25.45 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2885  acyltransferase 3  29.88 
 
 
385 aa  77  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  32.1 
 
 
632 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  32.32 
 
 
656 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  24.74 
 
 
603 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  24.74 
 
 
603 aa  75.5  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  28.97 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  36.2 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  23.89 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  36.2 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  36.2 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  28.57 
 
 
690 aa  73.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13370  predicted acyltransferase  37.42 
 
 
716 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.282089  normal  0.0669695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4604  acyltransferase 3  25.44 
 
 
372 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  26.89 
 
 
662 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  33.13 
 
 
625 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3854  putative acyltransferase  25.81 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  25.32 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  31.71 
 
 
681 aa  69.7  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  26.14 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0541  acyltransferase family protein  39.61 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1708  acyltransferase family protein  39.61 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110061  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  25.8 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0757  acyltransferase family protein  39.61 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156053  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1869  acyltransferase family protein  39.61 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  27.87 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2433  putative acyltransferase  39.61 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  28.42 
 
 
718 aa  69.3  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2294  putative acyltransferase  39.61 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1661  acyltransferase family protein  39.61 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  33.53 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  30.65 
 
 
680 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  35.57 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  26.39 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  27.38 
 
 
372 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4389  acyltransferase 3  25.62 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  30.65 
 
 
681 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  26.18 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3978  acyltransferase 3  25.62 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.642758  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  27.49 
 
 
598 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  30.65 
 
 
681 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  24.2 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6866  acyltransferase 3  26.93 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  26.96 
 
 
679 aa  67.8  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  28.81 
 
 
641 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  26.03 
 
 
381 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  31.74 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  32.35 
 
 
621 aa  67  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  24.17 
 
 
602 aa  67  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  31.86 
 
 
377 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3551  acyltransferase 3  25.86 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.39287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  25.06 
 
 
583 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  35 
 
 
675 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  29.38 
 
 
660 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  30.57 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  25.43 
 
 
734 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  30.29 
 
 
656 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  25.94 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  35.71 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0691  acyltransferase family protein  33.17 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  30.81 
 
 
660 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  29.03 
 
 
711 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  22.77 
 
 
716 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  32.91 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  32.92 
 
 
671 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  23.74 
 
 
715 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  32.32 
 
 
632 aa  64.3  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  33.33 
 
 
710 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  24.33 
 
 
376 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  33.33 
 
 
710 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  25.38 
 
 
584 aa  63.5  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  37.66 
 
 
354 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  23.94 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  37.66 
 
 
354 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>