More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2186 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  100 
 
 
369 aa  736    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  27.01 
 
 
366 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  30.08 
 
 
360 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4185  acyltransferase 3  33.33 
 
 
397 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.0405761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  28.14 
 
 
350 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0898  acyltransferase family protein  26.29 
 
 
367 aa  97.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0005281  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  29.63 
 
 
604 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  30.37 
 
 
383 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  29.6 
 
 
383 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5887  acyltransferase 3  24.49 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0355428  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  28.16 
 
 
408 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  27.65 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  26.37 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2192  acyltransferase 3  35.38 
 
 
625 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717297  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  29.31 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  24.94 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  24.68 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  26.24 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2754  acyltransferase 3  30 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  34.39 
 
 
632 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  28.74 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  28.74 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3227  acyltransferase 3  25.83 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  28.41 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  27.94 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  29.45 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  34.36 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  28.04 
 
 
656 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  35.93 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  26.48 
 
 
671 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1531  acyltransferase 3  28.33 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  33.53 
 
 
720 aa  75.5  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  25.27 
 
 
637 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  34.34 
 
 
977 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  26.15 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  26.05 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  32.5 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2885  acyltransferase 3  32.98 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0745  acyltransferase 3  26.1 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  32.92 
 
 
656 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  26.8 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  31.84 
 
 
680 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  31.49 
 
 
675 aa  73.2  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4586  acyltransferase 3  35 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0254963  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  32.5 
 
 
607 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  32.11 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  33.73 
 
 
711 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  37.5 
 
 
679 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  33.76 
 
 
681 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  33.76 
 
 
681 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  37.75 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  31.4 
 
 
665 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  31.74 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  32.78 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  35.19 
 
 
660 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2521  acyltransferase 3  32.12 
 
 
641 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.191199  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  29.2 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  25 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  34.39 
 
 
710 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  34.39 
 
 
710 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  28.62 
 
 
635 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  24.27 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  35.54 
 
 
710 aa  70.1  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5005  acyltransferase family protein  27.37 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  33.33 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000062652  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  33.33 
 
 
671 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  27.73 
 
 
662 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  35.22 
 
 
634 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  35.85 
 
 
718 aa  69.7  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  31.55 
 
 
654 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1062  acyltransferase 3  35.1 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.253972  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  34.08 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  29.83 
 
 
734 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  34.19 
 
 
671 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  32.96 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2326  acyltransferase 3  29.35 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  33.92 
 
 
695 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  33.33 
 
 
690 aa  68.9  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0830  acyltransferase 3  27.57 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  37.65 
 
 
673 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  37.12 
 
 
720 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  32.31 
 
 
638 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  27.01 
 
 
685 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  25.46 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  34.57 
 
 
660 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  26.58 
 
 
339 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  31.71 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  31.64 
 
 
695 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10112  transmembrane acyltransferase  34.45 
 
 
685 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  31.1 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  37.65 
 
 
667 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  34.43 
 
 
679 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  31.29 
 
 
603 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  31.52 
 
 
377 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  31.29 
 
 
603 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  29.06 
 
 
675 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  32.8 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  33.12 
 
 
635 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2545  acyltransferase 3  27.14 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0713139  normal  0.0487164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01286  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  37.6 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>