More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5910 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  100 
 
 
399 aa  781    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3303  acyltransferase 3  30.59 
 
 
389 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198239  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  30.36 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  31.87 
 
 
637 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.96 
 
 
695 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  31.33 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  29.2 
 
 
346 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  31.86 
 
 
368 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  30.11 
 
 
658 aa  90.1  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  30.77 
 
 
379 aa  89.7  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  30.11 
 
 
616 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  31.33 
 
 
364 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  31.23 
 
 
658 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  30.63 
 
 
377 aa  87  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  31 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  27.9 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  29.12 
 
 
682 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  34.98 
 
 
660 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1661  acyltransferase family protein  32.17 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1708  acyltransferase family protein  32.17 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1869  acyltransferase family protein  32.17 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0541  acyltransferase family protein  32.17 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.514154  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2294  putative acyltransferase  32.17 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  30.5 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  28.53 
 
 
583 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  30.41 
 
 
393 aa  81.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  27.76 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2433  putative acyltransferase  31.85 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142422  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0757  acyltransferase family protein  31.85 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156053  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  30.19 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  24.4 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  24.76 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  30.25 
 
 
632 aa  80.1  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  30.3 
 
 
667 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  30.35 
 
 
673 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  28.07 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2114  acyltransferase 3  30.37 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  34.98 
 
 
660 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  29.41 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  29.63 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0691  acyltransferase family protein  31.56 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0174  acyltransferase-like  28.69 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3971  acyltransferase 3  30 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181677  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  26.6 
 
 
656 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  26.64 
 
 
713 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  30.09 
 
 
710 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  30.09 
 
 
710 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  23.06 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  35.06 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  28.16 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3558  acyltransferase 3  30 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0624798  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  30.39 
 
 
615 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  27.73 
 
 
643 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  29.4 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  28.96 
 
 
629 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  25.07 
 
 
603 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  25.07 
 
 
603 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  25.82 
 
 
584 aa  73.9  0.000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  32.73 
 
 
691 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  36.8 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  26.58 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  29.57 
 
 
695 aa  73.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  34.93 
 
 
665 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6141  acyltransferase 3  31.71 
 
 
799 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1071  acyltransferase 3  29.65 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.710446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  36.21 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  27.07 
 
 
627 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  31.68 
 
 
695 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  29.07 
 
 
634 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  29.36 
 
 
598 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1920  acyltransferase 3  28.57 
 
 
383 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  26.79 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  31.62 
 
 
662 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  31.37 
 
 
645 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10660  predicted acyltransferase  27.27 
 
 
710 aa  70.5  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.307211  normal  0.545399 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  23.91 
 
 
622 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  28.61 
 
 
760 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2268  acyltransferase 3  25.59 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.638322  normal  0.0119035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  26.71 
 
 
660 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  27.78 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  29.95 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  30.65 
 
 
675 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  27.14 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  31.69 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2885  acyltransferase 3  31.7 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  25.45 
 
 
640 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4250  acyltransferase 3  30.28 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330616  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4116  acyltransferase 3  30.28 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  23.85 
 
 
696 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  27.91 
 
 
681 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  29.23 
 
 
683 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3407  acyltransferase 3  29.81 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  22.87 
 
 
604 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  22.87 
 
 
604 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  29.58 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  29.58 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.67 
 
 
656 aa  66.2  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1858  acyltransferase family protein  26.89 
 
 
636 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.772864  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1965  acyltransferase family protein  27.39 
 
 
375 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  30.34 
 
 
642 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>