240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2335 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  100 
 
 
356 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  90.73 
 
 
356 aa  624  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  54.67 
 
 
379 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  32.56 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  29.26 
 
 
359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  33.54 
 
 
372 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  29.92 
 
 
351 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  31.46 
 
 
342 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  30.86 
 
 
335 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  30.97 
 
 
357 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  27.79 
 
 
353 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  29.49 
 
 
354 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  29.8 
 
 
333 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  30.98 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  30.32 
 
 
339 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  28.73 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  28.61 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  30.73 
 
 
335 aa  89.4  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  31.29 
 
 
356 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  29.68 
 
 
338 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  28.9 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  29.43 
 
 
378 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  30.51 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  35.4 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  32.12 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  31.17 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  29.64 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.66 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  30.77 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  27.3 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  27.94 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  28.39 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  30.89 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  29.23 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  30.77 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  28.53 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  30.31 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  32.1 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  30.28 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  28.71 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  32.88 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  34.9 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  25.32 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  32.24 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  25.45 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  29.62 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  28.73 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  28.73 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  29.52 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  26.08 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  27.95 
 
 
356 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  32.43 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  27.58 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  29.28 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  30.63 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  28.61 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  28.24 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  33.12 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  34.63 
 
 
307 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  27.81 
 
 
391 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.85 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  27.55 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  27.55 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  27.55 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  28.88 
 
 
353 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  28.42 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  30.95 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  27.23 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  29.65 
 
 
695 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  28.88 
 
 
368 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  34.25 
 
 
358 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  27.2 
 
 
393 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0016  acyltransferase 3  26.32 
 
 
515 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  32.91 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  29.63 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4078  acyltransferase 3  26.17 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  30.06 
 
 
679 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  34.25 
 
 
564 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  33.55 
 
 
436 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  25.53 
 
 
363 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  27.32 
 
 
369 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  27.94 
 
 
643 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  25.42 
 
 
346 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  30.46 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  24.03 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  28.3 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2921  acyltransferase 3  31.65 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  38.89 
 
 
404 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4469  acyltransferase 3  30.72 
 
 
387 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.551657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2226  acyltransferase 3  25.36 
 
 
396 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5647  putative acyltransferase, group 3  27.76 
 
 
654 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  28.57 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  32 
 
 
407 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  32 
 
 
407 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  32 
 
 
407 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  25.72 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  27.49 
 
 
352 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  25.64 
 
 
349 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  38.89 
 
 
404 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  26.4 
 
 
351 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>