216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3179 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  100 
 
 		 362 aa  719    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.82 
 
 		 354 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  32.28 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  29.78 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  31.09 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  30.73 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  31.22 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  31.22 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  27.9 
 
 		 342 aa  99.8  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  31.5 
 
 		 384 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  31.56 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  30.28 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  32.13 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  31.21 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  30.41 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  29.95 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  30.43 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  31.35 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  29.91 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  29.4 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  31.15 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  26.54 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  31.02 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  28.18 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  25.85 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  30.97 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  35.9 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  31.53 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  27.22 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  28.27 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  36.18 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  28.15 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  28.45 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  36.47 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  29.2 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  34.87 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  27.35 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  32 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  29.8 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  29.24 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  28.16 
 
 		 351 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  29.67 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  30 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  30.45 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  26.61 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  27.7 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.23 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  26.44 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  32.75 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2227  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related membrane protein  25.92 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  29.73 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  35.22 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  28.43 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  25.81 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  34.55 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  33.8 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  25.48 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  33.33 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  25 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  27.3 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  26.39 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  26.81 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  32.89 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  34.39 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  24.37 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  24.42 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  27.97 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  25.38 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  25.41 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  24.74 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  27.6 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  25.46 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  35.4 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  24.67 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0727  acyltransferase-like protein  31.41 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  25.46 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  28.48 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  28.32 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  26.88 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  26.61 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  26.34 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0267  acyltransferase 3  26.33 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  30.27 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  25.47 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  38.24 
 
 		 392 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  29.82 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  23.25 
 
 		 309 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  26.5 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  25.27 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  24.92 
 
 		 377 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6866  acyltransferase 3  35.46 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0697  O-antigen acetylase, putative  24.23 
 
 		 410 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299213  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  23.36 
 
 		 350 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  34.29 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  24.32 
 
 		 358 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0809  acyltransferase 3  33.68 
 
 		 434 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  24.76 
 
 		 382 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  25 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  30.14 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  24.05 
 
 		 383 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>