202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2694 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  100 
 
 
327 aa  643    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  38.29 
 
 
367 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  40 
 
 
335 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  36.31 
 
 
354 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  33.33 
 
 
346 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  37.24 
 
 
342 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  35.73 
 
 
355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  37.13 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  31.36 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  36.86 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  35.69 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  36.01 
 
 
356 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  37.65 
 
 
382 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  36.99 
 
 
338 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  34.63 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  35.79 
 
 
357 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  32.96 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  32.96 
 
 
384 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  30.89 
 
 
342 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  32.94 
 
 
344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  37.97 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  32.53 
 
 
383 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  32.35 
 
 
344 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  33.03 
 
 
340 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  31.83 
 
 
351 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  32.73 
 
 
344 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  35.67 
 
 
362 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  33.03 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  35.85 
 
 
382 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  30.92 
 
 
337 aa  107  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  30.66 
 
 
364 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  33.23 
 
 
340 aa  106  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  34.59 
 
 
366 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  35.05 
 
 
348 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  32.69 
 
 
335 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  33.7 
 
 
356 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  30.95 
 
 
309 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  32.68 
 
 
354 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.25 
 
 
359 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  33.42 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  30.33 
 
 
357 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  30.61 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  30.41 
 
 
362 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  30.88 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  30.24 
 
 
383 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  30.87 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  30.87 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  32.2 
 
 
391 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.14 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  30.77 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  28.22 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  32.58 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.51 
 
 
639 aa  75.9  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  29.48 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  27.25 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  34.42 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  27.64 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  31.9 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  30.9 
 
 
671 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.69 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  30.55 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  27.89 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  29.38 
 
 
343 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  27.21 
 
 
658 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  31.05 
 
 
691 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  31.45 
 
 
716 aa  62.8  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  29.06 
 
 
658 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  31.36 
 
 
660 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  25.77 
 
 
384 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  31.46 
 
 
675 aa  59.3  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  32.9 
 
 
660 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  27.69 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  27.8 
 
 
622 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  32.17 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  34.01 
 
 
695 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  29.11 
 
 
642 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  26.25 
 
 
371 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.72 
 
 
690 aa  56.2  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  26.43 
 
 
690 aa  56.2  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  28.49 
 
 
637 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  27.76 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  29.66 
 
 
376 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  30.99 
 
 
366 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  31.79 
 
 
690 aa  53.9  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  30.3 
 
 
386 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  28.33 
 
 
354 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  28.65 
 
 
690 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  29.76 
 
 
638 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  28.01 
 
 
656 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  30.9 
 
 
364 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  25.98 
 
 
378 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  30.3 
 
 
394 aa  53.1  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  30.67 
 
 
508 aa  53.1  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  26.59 
 
 
657 aa  52.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  27.32 
 
 
353 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1939  acyltransferase 3  27.24 
 
 
341 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  26.99 
 
 
629 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  26.3 
 
 
657 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  31.97 
 
 
660 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  29.45 
 
 
662 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>