245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1984 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  100 
 
 		 344 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  91.55 
 
 		 383 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  91.55 
 
 		 344 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  88.92 
 
 		 344 aa  607  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  65.59 
 
 		 340 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  65.29 
 
 		 340 aa  447  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  60.62 
 
 		 333 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  49.85 
 
 		 340 aa  285  5.999999999999999e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  29.67 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  38.66 
 
 		 355 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  37.68 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  35.53 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  34.26 
 
 		 338 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  33.88 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  33.24 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  32.63 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  30.03 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  31.14 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  34.96 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  33.02 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  35.27 
 
 		 354 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  32.94 
 
 		 327 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  35.08 
 
 		 362 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  32.34 
 
 		 335 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  34.32 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  35.05 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  32.46 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  33.15 
 
 		 378 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  32.03 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  36.76 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  32.42 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  34.46 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  32.89 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  31.87 
 
 		 346 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  29.55 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  32.73 
 
 		 375 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  34.08 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  34.08 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  31.59 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  27.83 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  33.79 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  32.89 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  31.55 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  33.22 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.71 
 
 		 383 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  29.1 
 
 		 377 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  32.19 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  29.37 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  30.67 
 
 		 376 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  30.54 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  30.03 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  31.13 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  27.91 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  30.87 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  29.97 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  36.47 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  33.24 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  27.92 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  29.17 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  29.86 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4121  acyltransferase 3  31.21 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.184314  normal  0.5023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  28 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1160  acyltransferase 3  30.99 
 
 		 415 aa  67  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.287557  normal  0.799554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4702  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  27.93 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  24.29 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  28.65 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  26.61 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  31.42 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  28.12 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  27.02 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2110  acyltransferase 3  26.85 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0730198 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  26.78 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  30.72 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  28.85 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  25.51 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  26.96 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  25.51 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  25.51 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  40 
 
 		 389 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  27.27 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  31.18 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  27.83 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  25.14 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1871  acyltransferase 3  25 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3359  acyltransferase 3  27.3 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  24.18 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1903  acyltransferase 3  26.85 
 
 		 391 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210637 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  27.39 
 
 		 401 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  24.65 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  25.13 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  26.24 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  30.73 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  28.03 
 
 		 508 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4396  acyltransferase 3  28.62 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3971  acyltransferase 3  27.97 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  30.13 
 
 		 637 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  27.59 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1475  acyltransferase-like protein  32.52 
 
 		 415 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.536378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>