157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6862 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  100 
 
 
376 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  35 
 
 
356 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  34.59 
 
 
384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  31.91 
 
 
336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  35.08 
 
 
335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  31.78 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  32.07 
 
 
359 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  31.47 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  31.59 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  31.34 
 
 
363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  29.64 
 
 
378 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  31.84 
 
 
382 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  31.13 
 
 
364 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  28.96 
 
 
342 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  32.61 
 
 
354 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  32.55 
 
 
366 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  32.23 
 
 
346 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  32.6 
 
 
337 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  32.98 
 
 
348 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  29.52 
 
 
357 aa  99.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  29.65 
 
 
367 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  32.39 
 
 
354 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  30.92 
 
 
354 aa  99  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  31.3 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  31.83 
 
 
340 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  30 
 
 
357 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  29.58 
 
 
354 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  35.4 
 
 
362 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  30.77 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  31.78 
 
 
355 aa  93.6  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  30.25 
 
 
340 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  29.68 
 
 
353 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  33.96 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  32.05 
 
 
377 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  30.77 
 
 
344 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  34.07 
 
 
340 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  29.75 
 
 
344 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  32.27 
 
 
382 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  31.41 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  30.48 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  30.45 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  30.75 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  29.28 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  34.51 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  36.97 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.96 
 
 
374 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  28.69 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  26.61 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  27.95 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  28.3 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  33.33 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  26.89 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  27.99 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  27.99 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  35.29 
 
 
354 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  32.57 
 
 
307 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  27.53 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  29.56 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  35.71 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  31.21 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  31.58 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  26.15 
 
 
393 aa  62.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  25.45 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  28.91 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  27.69 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  30.77 
 
 
695 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0904  acyltransferase family protein  27.47 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0244646  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  26.49 
 
 
353 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  31.87 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3900  acyltransferase 3  27.47 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  28.1 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1666  acyltransferase 3  23.78 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  33.61 
 
 
389 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  27.03 
 
 
366 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3504  acyltransferase 3  27.05 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1186  acyltransferase-like protein  25.93 
 
 
406 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  31.11 
 
 
632 aa  49.7  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5002  acyltransferase family protein  28.81 
 
 
362 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0732  hypothetical protein  25.07 
 
 
398 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  23.82 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5194  acyltransferase 3  29.14 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3966  acyltransferase 3  28.8 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  27.74 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4040  acyltransferase 3  28.8 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  28.4 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  28.8 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4679  acyltransferase 3  26.8 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.876783  normal  0.177775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  31.09 
 
 
671 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  26.94 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4595  acyltransferase 3  31 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3937  acyltransferase 3  34.09 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  25.59 
 
 
374 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  29.56 
 
 
382 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  28.4 
 
 
363 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1298  acyltransferase 3  30.25 
 
 
363 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  26.15 
 
 
394 aa  46.6  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4406  acyltransferase 3  24.68 
 
 
380 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  25.32 
 
 
387 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  29.44 
 
 
364 aa  46.2  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  27.7 
 
 
390 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>