227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0759 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  100 
 
 
336 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  45.18 
 
 
335 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  37.82 
 
 
354 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  38.44 
 
 
342 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  35.69 
 
 
338 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  35.19 
 
 
339 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  32.66 
 
 
354 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  35.21 
 
 
333 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  34.68 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  35.69 
 
 
327 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  32.47 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  35.03 
 
 
348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  32.95 
 
 
342 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  30.11 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  36.04 
 
 
351 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  35.05 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  35.69 
 
 
367 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  35.11 
 
 
378 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  32.02 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  32.27 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  31.69 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  36.54 
 
 
382 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  33.76 
 
 
344 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  33.76 
 
 
344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  33.52 
 
 
364 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  34.41 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  37.22 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  36.63 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  37.25 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  34.68 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  35.67 
 
 
356 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  27.74 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  33.53 
 
 
355 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  38.65 
 
 
384 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  36.24 
 
 
366 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  33.72 
 
 
356 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  33.53 
 
 
335 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  29.46 
 
 
357 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  32.21 
 
 
360 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  33.99 
 
 
357 aa  100  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  27.83 
 
 
346 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  35.75 
 
 
382 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  28.99 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  32.65 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  32.08 
 
 
395 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  32.08 
 
 
395 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  31.9 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  32.95 
 
 
354 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  27.13 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  28.91 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  30.25 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  33.33 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  27.9 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  29.59 
 
 
362 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  32.9 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  29.18 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  30.13 
 
 
351 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  30.62 
 
 
379 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  32.52 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  25.6 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  31.06 
 
 
638 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  25.07 
 
 
584 aa  65.1  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  33.13 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  28.64 
 
 
587 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0525  acyltransferase 3  24.86 
 
 
583 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0373578  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  23.86 
 
 
603 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  30.92 
 
 
354 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  29.04 
 
 
561 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  28.94 
 
 
403 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  28.49 
 
 
366 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  31.13 
 
 
508 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2282  putative acyltransferase  30.62 
 
 
418 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  33.51 
 
 
667 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  27.91 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  33.09 
 
 
386 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  32.26 
 
 
635 aa  56.2  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  32.3 
 
 
397 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  34.21 
 
 
389 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2186  acyltransferase  26.2 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  26.9 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  34.87 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  28.11 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  32.39 
 
 
360 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  26.47 
 
 
385 aa  53.9  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  34.46 
 
 
683 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  34.29 
 
 
378 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  31.29 
 
 
354 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10230  integral membrane acyltransferase  26.36 
 
 
407 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.92754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0830  acyltransferase 3  28.88 
 
 
384 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  26.9 
 
 
637 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1310  acyltransferase 3  32.03 
 
 
621 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.502976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  32.53 
 
 
392 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1096  acyltransferase 3  31.01 
 
 
614 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  22.1 
 
 
384 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  28.19 
 
 
353 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.87 
 
 
343 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  32 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1075  putative acyltransferase  28.21 
 
 
352 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2762  acyltransferase 3  34.84 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.595683  normal  0.224003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  32.89 
 
 
642 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>