198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1528 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  100 
 
 
363 aa  673    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  81.42 
 
 
382 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  80.6 
 
 
366 aa  494  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  58.31 
 
 
382 aa  293  4e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  42.38 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  40.17 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  40.27 
 
 
357 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  35.39 
 
 
367 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  37.67 
 
 
327 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  36.84 
 
 
378 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  36.24 
 
 
354 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  36.98 
 
 
356 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  32.43 
 
 
367 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  34.73 
 
 
338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  37.98 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  37.98 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  33.89 
 
 
339 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  31.64 
 
 
346 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  30.99 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  34.93 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  35.99 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  34.05 
 
 
384 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  31.61 
 
 
335 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  35.73 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  31.35 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  37.5 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  31.42 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  33.43 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  33.7 
 
 
354 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  33.16 
 
 
357 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.66 
 
 
353 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  31 
 
 
362 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  30.85 
 
 
340 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  31.64 
 
 
383 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  27.89 
 
 
377 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  32.78 
 
 
340 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  31.34 
 
 
344 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  34.47 
 
 
351 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  31.98 
 
 
344 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  31.01 
 
 
344 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  33.15 
 
 
354 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  30.77 
 
 
351 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  36.96 
 
 
375 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.38 
 
 
359 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  29.71 
 
 
354 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  31.65 
 
 
360 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  32.77 
 
 
335 aa  92.8  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  27.71 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.29 
 
 
383 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  28.13 
 
 
337 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  31.38 
 
 
362 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  34.08 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  31 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  36.45 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  33.64 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  26.23 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  29.81 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  28.88 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  31.55 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  39.15 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  25.46 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  30.31 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2652  acyltransferase family protein  28.57 
 
 
375 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1965  acyltransferase family protein  28.89 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  30.12 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2566  acyltransferase family protein  28.57 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  28.81 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  29.46 
 
 
587 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  27.72 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2513  acyltransferase family protein  28.25 
 
 
375 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  23 
 
 
384 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2426  putative acyltransferase  29.04 
 
 
390 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3868  acyltransferase 3  28.35 
 
 
391 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0728  acyltransferase 3  29.41 
 
 
396 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.416646  normal  0.548123 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1626  acyltransferase family protein  28.89 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  37.43 
 
 
564 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3365  acyltransferase 3  28.35 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2128  acyltransferase family protein  28.89 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3186  acyltransferase family protein  28.89 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1402  acyltransferase family protein  28.89 
 
 
375 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  33.06 
 
 
681 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.03 
 
 
343 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  29.82 
 
 
389 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  28.57 
 
 
658 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  32.53 
 
 
682 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  25.96 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  27.42 
 
 
622 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  27.72 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1075  acyltransferase 3  30.35 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.636973  normal  0.239028 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  29.01 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  30.08 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  29.01 
 
 
410 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1134  acyltransferase 3  36.31 
 
 
391 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  28.46 
 
 
365 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0432  acyltransferase 3  31.52 
 
 
362 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  25.19 
 
 
381 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  28.32 
 
 
561 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  23.69 
 
 
348 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  26.84 
 
 
366 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1837  acyltransferase 3  29.54 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>